RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-216	ENST00000583282	SYS1	Q8N2H4	156 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	MYDGF	Q969H8	173 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	OPA3	Q9H6K4	179 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	GPR84	Q9NQS5	396 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	CD300LB	A8K4G0	201 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282		E9PI62	339 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	RGS10	O43665	173 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	LY6H	O94772	140 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	BMP4	P12644	408 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	SELE	P16581	610 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	KITLG	P21583	273 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	TUBG1	P23258	451 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	EVX1	P49640	407 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF81	P51508	661 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	MMP16	P51512	607 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	ATP5J2	P56134	94 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	CSNK2B	P67870	215 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	SLC35A2	P78381	396 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	KLB	Q86Z14	1044 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	NINJ1	Q92982	152 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	SGK3	Q96BR1	496 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	HAVCR1	Q96D42	359 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	RGCC	Q9H4X1	137 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	GPR160	Q9UJ42	338 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282		H7C417	338 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	OVOL3	O00110	214 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	MAGEB1	P43366	347 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	GSK3A	P49840	483 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	MMP15	P51511	669 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	FAM3A	P98173	230 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	XAF1	Q6GPH4	301 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282		Q6ZR03	302 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	OR52N1	Q8NH53	320 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	SPSB4	Q96A44	273 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
GGA3-216	ENST00000583282	USF3	Q68DE3	2245 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282		A0A0U1RQV5	110 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282		A0A1B0GVI7	797 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	ACOD1	A6NK06	481 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	C17orf100	A8MU93	164 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	NCR1	O76036	304 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	LALBA	P00709	142 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	IGHV1-46	P01743	117 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	IGHV4-39	P01824	125 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	ACKR3	P25106	362 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	WNT4	P56705	351 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	DOC2B	Q14184	412 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	CARTPT	Q16568	116 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	MOG	Q16653	247 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	OR8G5	Q8NG78	346 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	MND1	Q9BWT6	205 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	POLQ	O75417	2590 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GGA3-216	ENST00000583282	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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