RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	MFSD4A	Q8N468	514 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	NDNF	Q8TB73	568 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	BORCS5	Q969J3	196 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	MAL2	Q969L2	176 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TAMM41	Q96BW9	452 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PANX1	Q96RD7	426 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	DUSP26	Q9BV47	211 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OR51B5	Q9H339	312 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RLIM	Q9NVW2	624 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PSME2	Q9UL46	239 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RCE1	Q9Y256	329 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	GMEB1	Q9Y692	573 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772		A0A0A6YYD5	115 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	EVPLL	A8MZ36	301 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772		J3KTA2	159 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772		M0R082	166 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772		M0R129	80 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TGOLN2	O43493	480 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SULT1C4	O75897	302 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	GABARAP	O95166	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	UTS2	O95399	124 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TGFB1	P01137	390 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	LCK	P06239	509 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ARSB	P15848	533 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PCSK2	P16519	638 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TACR3	P29371	465 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	AQP1	P29972	269 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	GRK5	P34947	590 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TGFBR1	P36897	503 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PMEL	P40967	661 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PRKAG1	P54619	331 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RAD23A	P54725	363 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	HBA1	P69905	142 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	IFITM3	Q01628	133 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	EPS8	Q12929	822 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TMED1	Q13445	227 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RFX4	Q33E94	735 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PLA1A	Q53H76	456 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SYT14P1	Q58G82	188 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	MED27	Q6P2C8	311 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC80	Q76M96	950 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF627	Q7L945	461 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	LYG2	Q86SG7	212 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RNF130	Q86XS8	419 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	VRK2	Q86Y07	508 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	CCDC103	Q8IW40	242 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	LAS2	Q8IYD9	372 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PNKD	Q8N490	385 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	COMMD1	Q8N668	190 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772		Q8N7P7	452 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF614	Q8N883	585 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SMYD1	Q8NB12	490 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	NFKBID	Q8NI38	313 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	GIPC3	Q8TF64	312 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		3.78	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8

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