RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 OPRL1P41146 370 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 GZMKP49863 264 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 CDH15P55291 814 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 CXCR4P61073 352 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZNF92Q03936 586 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 POU4F2Q12837 409 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 RIN1Q13671 783 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 RCN1Q15293 331 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 OR8G1Q15617 311 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TRIP10Q15642 601 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 Q6ZR03 302 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 COMMD2Q86X83 199 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ITLN1Q8WWA0 313 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 REEP6Q96HR9 211 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 OR2V2Q96R30 315 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TBX5Q99593 518 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 NIPAL2Q9H841 368 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 LRP12Q9Y561 859 aa6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 LRRC30A6NM36 301 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SNTNA6NMZ2 147 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 CD300LBA8K4G0 201 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 F5H5P2 479 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 CD5LO43866 347 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZNF254O75437 659 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 APOL3O95236 402 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TGFAP01135 160 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 HLA-DPB1P04440 258 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SBK2P0C263 348 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 IRF2P14316 349 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ANPEPP15144 967 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 CA6P23280 308 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 HTR1FP30939 366 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 GNALP38405 381 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 DEFA6Q01524 100 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TMED1Q13445 227 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 FAM166AQ6J272 317 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 FTMTQ8N4E7 242 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 OR8S1Q8NH09 359 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 OR8B4Q96RC9 309 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 MNTQ99583 582 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SLC29A1Q99808 456 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 SLC22A4Q9H015 551 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 CLN6Q9NWW5 311 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 UBAP1Q9NZ09 502 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 CACNG2Q9Y698 323 aa6.59□□□□□ -1.35
SMG6-211ENST00000572369 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.367e-7■□□□□ 8.9
SMG6-211ENST00000572369 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 A0A096LNT2 108 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 C5orf63A6NC05 138 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 H0YHG0 523 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 IFNL4K9M1U5 179 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MLNRO43193 412 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 MPZL2O60487 215 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 GMDSO60547 372 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 LILRA1O75019 489 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 RP2O75695 350 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 KRT8P05787 483 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 TACSTD2P09758 323 aa6.58□□□□□ -1.36
SMG6-211ENST00000572369 DDOSTP39656 456 aa6.58□□□□□ -1.36
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