RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569252.5

USB1-215, Transcript of U6 snRNA biogenesis phosphodiesterase 1, human

TSL 4

Gene USB1, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USB1-215	ENST00000569252	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MVK	Q03426	396 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MED22	Q15528	200 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CCDC58	Q4VC31	144 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	FAM206A	Q9NX38	181 aa		13.77	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ZNF250	P15622	560 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	LIPA	P38571	399 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TAS2R43	P59537	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ERVS71-1	P61550	626 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	FTMT	Q8N4E7	242 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ITFG2	Q969R8	447 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SGK3	Q96BR1	496 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	HAVCR1	Q96D42	359 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PELI1	Q96FA3	418 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252		A0A0U1RQV5	110 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252		A0A1B0GVI7	797 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MT-ND2	P03891	347 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ZNF12	P17014	697 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	DDOST	P39656	456 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TGM4	P49221	684 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CCR9	P51686	369 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ZNF92	Q03936	586 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SPHAR	Q15513	63 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ODF4	Q2M2E3	257 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ZNF649	Q9BS31	505 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		13.75	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SYT7	O43581	403 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PNP	P00491	289 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	IGHV3-13	P01766	116 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	HSMCR30	P0CW71	290 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ATP6V1B1	P15313	513 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MAP2K3	P46734	347 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PSG7	Q13046	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	EFNB3	Q15768	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	FDX2	Q6P4F2	183 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SGCD	Q92629	289 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PIGT	Q969N2	578 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CCL19	Q99731	98 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252		A0A087WXM4	84 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	P2RY10	O00398	339 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USB1-215	ENST00000569252	CLPTM1	O96005	669 aa		13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms