RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 IDNKQ5T6J7 187 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D15Q8TC07 691 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 MUCL1Q96DR8 90 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRC46Q96FV0 321 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDH20Q9HBT6 801 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 RTTNQ86VV8 2226 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 C16orf97H3BN30 126 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGS5O15539 181 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 XRCC2O43543 280 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 DHRS3O75911 302 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 BMXP51813 675 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 AP3S1Q92572 193 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR51B6Q9H340 312 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGLV3-1P01715 115 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 S100A5P33763 92 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP3R1P63098 170 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 MALLQ13021 153 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 DACH2Q96NX9 599 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 RGCCQ9H4X1 137 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 V9GY05 133 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM208BQ5VWN6 2430 aa14.92□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOTOA8MTQ0 251 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGKV3-15P01624 115 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAX7P23759 505 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRSS12P56730 875 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF92Q03936 586 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 COLCA1Q6ZS62 124 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 V9GYS6 101 aa14.91□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A075B6Q4 140 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 NGFP01138 241 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 FSTP19883 344 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPOCK1Q08629 439 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPA1Q15181 289 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR10A4Q9H209 315 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 STARD10Q9Y365 291 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0G2JK05 382 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTDSP2O14595 271 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPXP11678 715 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADRA2CP18825 462 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGAP20933 346 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 WNT5AP41221 380 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP2K3P46734 347 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF83P51522 516 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSMD7P51665 324 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 HES5Q5TA89 166 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 XKRXQ6PP77 449 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR13C9Q8NGT0 318 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 GFI1Q99684 422 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.9□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAHP16930 419 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.6 ms