RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 PAX6P26367 422 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 RPS6KA3P51812 740 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 IKZF1Q13422 519 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 LY6EQ16553 131 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 FGD3Q5JSP0 725 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 ADCK1Q86TW2 530 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 FAM216BQ8N7L0 139 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 SLC26A10Q8NG04 563 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 OR4K13Q8NH42 304 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.22□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 A0A1B0GVI7 797 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 CXCR6O00574 342 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 NPFFO15130 113 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 EDF1O60869 148 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 DIRAS1O95057 198 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 SERPINA1P01009 418 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 SLC2A1P11166 492 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 SELLP14151 372 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 CRABP1P29762 137 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 GABRA5P31644 462 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 OMPP47874 163 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 TPTEP56180 551 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 HERPUD1Q15011 391 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 SEC23BQ15437 767 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 OXLD1Q5BKU9 147 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 WDR38Q5JTN6 314 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 GLYATL3Q5SZD4 288 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 DNM1P34Q6PK57 102 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 Q6ZTK2 550 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 OR5T2Q8NGG2 359 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 OR52J3Q8NH60 311 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 C17orf50Q8WW18 174 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 MAP6Q96JE9 813 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 AURKCQ9UQB9 309 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 TMEM5Q9Y2B1 443 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 KPTNQ9Y664 436 aa13.21□□□□□ -0.29
CS-227ENST00000551441 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 MEIOCA2RUB1 952 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 M0R135 149 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 GSTA4O15217 222 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NDUFA2O43678 99 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 GMDSO60547 372 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 TXNDC12O95881 172 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ECDO95905 644 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 PAHP00439 452 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 OPN1MWP04001 364 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 OPN1MW2P0DN77 364 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 OPN1MW3P0DN78 364 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NCK1P16333 377 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 TGFBR2P37173 567 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 PCK2Q16822 640 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 RFX4Q33E94 735 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 CBLL1Q75N03 491 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 Q8N7P7 452 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SDR9C7Q8NEX9 313 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 OR56B2PQ8NGI1 322 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 LRRC29Q8WV35 223 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 STON2Q8WXE9 905 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 RORBQ92753 470 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 RCN3Q96D15 328 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ZNF799Q96GE5 643 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 GID8Q9NWU2 228 aa13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 TVP23AA6NH52 213 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 H3BUX3 64 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ACOT8O14734 319 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 RENP00797 406 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 LHBP01229 141 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 H1F0P07305 194 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 PSKH1P11801 424 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 PYCR1P32322 319 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 PRKXP51817 358 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 CSNK2BP67870 215 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 LIPEQ05469 1076 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 ECH1Q13011 328 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 TEX36Q5VZQ5 186 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 PGM2L1Q6PCE3 622 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SMARCD3Q6STE5 483 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 LYPD4Q6UWN0 246 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 WDR86Q86TI4 376 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 CYP4Z1Q86W10 505 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 C11orf53Q8IXP5 236 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.19□□□□□ -0.3
CS-227ENST00000551441 SLC22A4Q9H015 551 aa13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.2 ms