RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GHSR	Q92847	366 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CA10	Q9NS85	328 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GPR160	Q9UJ42	338 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PPW3	197 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ISG15	P05161	165 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OCM2	P0CE71	109 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	RAC2	P15153	192 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CD36	P16671	472 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TTK	P33981	857 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	THBS4	P35443	961 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	FABP6	P51161	128 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	MOG	Q16653	247 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ITFG2	Q969R8	447 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	FBXW5	Q969U6	566 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SPSB4	Q96A44	273 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SGK3	Q96BR1	496 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CMBL	Q96DG6	245 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	POFUT1	Q9H488	388 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PLSCR5	A0PG75	271 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SIAH2	O43255	324 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PLAU	P00749	431 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	HLA-DPB1	P04440	258 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CCL1	P22362	96 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GNAL	P38405	381 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	LIPA	P38571	399 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DDOST	P39656	456 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SOX2	P48431	317 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GSK3A	P49840	483 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	FAM3A	P98173	230 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658		Q499Y3	187 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	RDH10	Q8IZV5	341 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR5AS1	Q8N127	324 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ACBD4	Q8NC06	268 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM203	Q969S6	136 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	LYZL4	Q96KX0	146 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PLK3	Q9H4B4	646 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	STUB1	Q9UNE7	303 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SSR3	Q9UNL2	185 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	C5orf63	A6NC05	138 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV3-1	P01715	115 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR4A8	P0C604	315 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	MPV17	P39210	176 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DOC2B	Q14184	412 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR8B8	Q15620	311 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SSX1	Q16384	188 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR2T2	Q6IF00	324 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.21	□□□□□ -0.77

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