RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	FFAR1	O14842	300 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	CD14	P08571	375 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	RAB13	P51153	203 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	SLC18A1	P54219	525 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	VMAC	Q2NL98	169 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	OAF	Q86UD1	273 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	DDO	Q99489	341 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	RHCG	Q9UBD6	479 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		9.82	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM120B	A0PK00	339 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557		J3KTA2	159 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	LCAT	P04180	440 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	ERVFRD-1	P60508	538 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	STX1B	P61266	288 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	CSNK2B	P67870	215 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	CD83	Q01151	205 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	PRKCD	Q05655	676 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	ACSM1	Q08AH1	577 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	PGAP1	Q75T13	922 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	GJC3	Q8NFK1	279 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC29	Q8WV35	223 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		9.81	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557		A6NLC8	198 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	AHCYL1	O43865	530 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	GMDS	O60547	372 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	PTP4A3	O75365	173 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	GPR4	P46093	362 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	FXYD6P3	P58550	94 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	BLCAP	P62952	87 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	DGUOK	Q16854	277 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	DPP10	Q8N608	796 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF570	Q96NI8	536 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	CENPH	Q9H3R5	247 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		9.8	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557		A0A087WUU8	490 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	SOCS2	O14508	198 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	NDUFB3	O43676	98 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	PSKH1	P11801	424 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	ZBED5	Q49AG3	693 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	RABL3	Q5HYI8	236 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	STUM	Q69YW2	141 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	WDR82	Q6UXN9	313 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM219	Q86XT9	240 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	MAP6	Q96JE9	813 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557		U3KQK5	164 aa		9.79	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557		M0R1W7	72 aa		9.78	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	XKRY	O14609	159 aa		9.78	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	9.78	□□□□□ -0.84
BBS1-222	ENST00000533557	GGT2	P36268	569 aa		9.78	□□□□□ -0.84

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