RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC29A1Q99808 456 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC30A2Q9BRI3 323 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC22A4Q9H015 551 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-206ENST00000520462 HAO2Q9NYQ3 351 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-206ENST00000520462 TREM2Q9NZC2 230 aa13.09□□□□□ -0.31
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TSNARE1-206ENST00000520462 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
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TSNARE1-206ENST00000520462 SNTNA6NMZ2 147 aa13.07□□□□□ -0.32
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TSNARE1-206ENST00000520462 IGHV4-31P0DP07 118 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 CXCR4P61073 352 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 OR8G1Q15617 311 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 AVPI1Q5T686 147 aa13.07□□□□□ -0.32
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TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF679Q8IYX0 411 aa13.07□□□□□ -0.32
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TSNARE1-206ENST00000520462 FTMTQ8N4E7 242 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 OR10H4Q8NGA5 316 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 OR2T27Q8NH04 317 aa13.06□□□□□ -0.32
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TSNARE1-206ENST00000520462 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 ZNF391Q9UJN7 358 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 WIPI2Q9Y4P8 454 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa13.05□□□□□ -0.32
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TSNARE1-206ENST00000520462 GMDSO60547 372 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 APOL3O95236 402 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 KRT8P05787 483 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 ANOS1P23352 680 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 DCTDP32321 178 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 FAM3AP98173 230 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 EGR3Q06889 387 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 MZT1Q08AG7 82 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 OCLNQ16625 522 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 COMMD2Q86X83 199 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-206ENST00000520462 KLBQ86Z14 1044 aa13.05□□□□□ -0.32
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