RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CDH20Q9HBT6 801 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 NOX3Q9HBY0 568 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM36Q9NQ86 728 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 SCOCQ9UIL1 159 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 C5orf49A4QMS7 147 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 PRR32B1ATL7 298 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 M0R135 149 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 LY6HO94772 140 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 RPP14O95059 124 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ABHD16AO95870 558 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CLPTM1O96005 669 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV1-44P01699 117 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 FAM157CP0CG43 387 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CCNOP22674 350 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 SLC6A9P48067 706 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 RGS6P49758 472 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 MMP16P51512 607 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 PRKXP51817 358 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 EFNA4P52798 201 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 BDH1Q02338 343 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ACSM1Q08AH1 577 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC58Q4VC31 144 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 PELI1Q96FA3 418 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF799Q96GE5 643 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 BEX2Q9BXY8 128 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 R4GMQ9 66 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 LOC100509620A0A075B734 347 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CRYAAP02489 173 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ACSM4P0C7M7 580 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CECR9P0C854 216 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 HSMCR30P0CW71 290 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 PCMT1P22061 227 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 TGM4P49221 684 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CX3CR1P49238 355 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 FDX2Q6P4F2 183 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 BRICD5Q6PL45 260 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 KLBQ86Z14 1044 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF485Q8NCK3 441 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 C10orf105Q8TEF2 133 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 C4orf45Q96LM5 186 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 COG8Q96MW5 612 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 OR5M11Q96RB7 305 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 MGLLQ99685 303 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ACOXLQ9NUZ1 547 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 SPEF1Q9Y4P9 236 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 J3QW42 95 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 LCATP04180 440 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 LCKP06239 509 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CELA3BP08861 270 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 DBHP09172 617 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CSF3P09919 207 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 PSMB9P28065 219 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 PSMB10P40306 273 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 RAD52P43351 418 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CCR9P51686 369 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 NAAAQ02083 359 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 GPR50Q13585 617 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 NEDD8Q15843 81 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CARTPTQ16568 116 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 CYB5R2Q6BCY4 276 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2B-208ENST00000511807 SLC7A6Q92536 515 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms