RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506063.1

TCOF1-208, Transcript of treacle ribosome biogenesis factor 1, human

TSL 4

Gene TCOF1, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCOF1-208	ENST00000506063	RHBDL1	O75783	438 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	AHSA1	O95433	338 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HLA-DPB1	P04440	258 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	GUSB	P08236	651 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	PGA5	P0DJD9	388 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ETFA	P13804	333 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ZNF32	P17041	273 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	IFNA8	P32881	189 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CD200	P41217	278 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CDKN2C	P42773	168 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	TGM4	P49221	684 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	POU3F4	P49335	361 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ENTPD1	P49961	510 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	IDH3A	P50213	366 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	KCNJ10	P78508	379 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	TNFRSF9	Q07011	255 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SCARB2	Q14108	478 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HIST3H3	Q16695	136 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SLC36A2	Q495M3	483 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	GTDC1	Q4AE62	458 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	COQ5	Q5HYK3	327 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	WDR38	Q5JTN6	314 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	EPGN	Q6UW88	154 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063		Q6ZR54	194 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	MAVS	Q7Z434	540 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	MKX	Q8IYA7	352 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CADM2	Q8N3J6	435 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HIPK4	Q8NE63	616 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	OR8G5	Q8NG78	346 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	STK35	Q8TDR2	534 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	TAAR8	Q969N4	342 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SLC35B4	Q969S0	331 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ERGIC1	Q969X5	290 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	TMEM106A	Q96A25	262 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	VPS33A	Q96AX1	596 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	RNF183	Q96D59	192 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	TMEM19	Q96HH6	336 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	C4orf45	Q96LM5	186 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	EPYC	Q99645	322 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	SH3GL1	Q99961	368 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	EBF4	Q9BQW3	602 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	GID8	Q9NWU2	228 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	GLTP	Q9NZD2	209 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	APLN	Q9ULZ1	77 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	STARD10	Q9Y365	291 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	IFT52	Q9Y366	437 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	LRP12	Q9Y561	859 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		2.55	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063		A0A0G2JPF8	293 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	MSGN1	A6NI15	193 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	DYNC1I1	O14576	645 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	IMPA2	O14732	288 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	ACOT8	O14734	319 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	AIM2	O14862	343 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	GSTA4	O15217	222 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HSPA12A	O43301	675 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	PSPN	O60542	156 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	CCDC22	O60826	627 aa		2.54	□□□□□ -2
TCOF1-208	ENST00000506063	IFNA14	P01570	189 aa		2.54	□□□□□ -2

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