RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 PLPP2O43688 288 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 CTAG2O75638 210 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 DHRS3O75911 302 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 HLA-DPB1P04440 258 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 OR4A8P0C604 315 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF250P15622 560 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 ACHEP22303 614 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 CALCRP30988 508 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 THBS4P35443 961 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 PSMB10P40306 273 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 PPP3R1P63098 170 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 SLC3A1Q07837 685 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 CDK5R1Q15078 307 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF611Q8N823 705 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 KBTBD8Q8NFY9 601 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 OR13G1Q8NGZ3 307 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 OR8S1Q8NH09 359 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 OR51E1Q8TCB6 317 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 PP6455Q8WZ26 134 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 PHYHIPQ92561 330 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 PIGTQ969N2 578 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 HAVCR1Q96D42 359 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 CMBLQ96DG6 245 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 TMEM100Q9NV29 134 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 STARD10Q9Y365 291 aa8.4□□□□□ -1.06
CTPS1-210ENST00000486889 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.4□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SHISA9B4DS77 424 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF879B4DU55 563 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 OGG1O15527 345 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 GMDSO60547 372 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ARL6IP5O75915 188 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 NGFP01138 241 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV3-13P01766 116 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CPEP16870 476 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 WNT5AP41221 380 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 HGFACQ04756 655 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 IRF3Q14653 427 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 EFNB3Q15768 340 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 NEDD8Q15843 81 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 WDR38Q5JTN6 314 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 GLYATL3Q5SZD4 288 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 UBE2UQ5VVX9 321 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SPSB4Q96A44 273 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 GPR84Q9NQS5 396 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CBLN4Q9NTU7 201 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 DECR2Q9NUI1 292 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SLC7A11Q9UPY5 501 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 MPC1Q9Y5U8 109 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 CD300LBA8K4G0 201 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 P2RY10O00398 339 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 TTRP02766 147 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 RAF1P04049 648 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 PSKH1P11801 424 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 TNFRSF1AP19438 455 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-210ENST00000486889 KITLGP21583 273 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms