RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467080.1

RBM17-208, Transcript of RNA binding motif protein 17, human

TSL 2

Gene RBM17, Length 837 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM17-208	ENST00000467080	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080		H3BTX0	84 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	ABCD4	O14678	606 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	CFLAR	O15519	480 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	TAPBP	O15533	448 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	CBR3	O75828	277 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	MELTF	P08582	738 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	HNF1A	P20823	631 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	MAGEA1	P43355	309 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	SLC1A6	P48664	564 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	GSK3B	P49841	420 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	RWDD2B	P57060	319 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	TNFRSF17	Q02223	184 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	RBBP4	Q09028	425 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	SLAMF1	Q13291	335 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	TRIP10	Q15642	601 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	PDK4	Q16654	411 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	NRF1	Q16656	503 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	DSN1	Q9H410	356 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	MED11	Q9P086	117 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	RYR2	Q92736	4967 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	PLPP1	O14494	284 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	CXCL13	O43927	109 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	BANF1	O75531	89 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	LYZL6	O75951	148 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	SCEL	O95171	688 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	GPR75	O95800	540 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	GSTA1	P08263	222 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	AGTR1	P30556	359 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	SSR2	P43308	183 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	SPIB	Q01892	262 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	STX5	Q13190	355 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	RAB35	Q15286	201 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	LTB4R	Q15722	352 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	STK11	Q15831	433 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	SVOPL	Q8N434	492 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	OR2M3	Q8NG83	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	TMBIM1	Q969X1	311 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	VSTM2L	Q96N03	204 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080		H7C417	338 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RBM17-208	ENST00000467080	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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