RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CX3CR1P49238 355 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 GZMKP49863 264 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 CCR6P51684 374 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 PRKXP51817 358 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ZP1P60852 638 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 OR11H7Q8NGC8 314 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 OR52N4Q8NGI2 321 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 MED30Q96HR3 178 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRC-210ENST00000462363 AP3S2P59780 193 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 PMPCAQ10713 525 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 ECH1Q13011 328 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 FCN2Q15485 313 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 GUSBP1Q15486 140 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-210ENST00000462363 TGIF1Q15583 401 aa4.93□□□□□ -1.62
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