RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	TLDC2	A0PJX2	215 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	GLCE	O94923	617 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	LY86	O95711	162 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	LHB	P01229	141 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	MT-ND1	P03886	318 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	TFF1	P04155	84 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	LCAT	P04180	440 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	BPGM	P07738	259 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	BMP2	P12643	396 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	THBS3	P49746	956 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	MALL	Q13021	153 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	FADD	Q13158	208 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	AQP6	Q13520	282 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	SCARB2	Q14108	478 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	PCK2	Q16822	640 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	DUSP7	Q16829	419 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	PGAP1	Q75T13	922 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	NAA40	Q86UY6	237 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	MKX	Q8IYA7	352 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	LNX2	Q8N448	690 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	MPP4	Q96JB8	637 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	LYZL4	Q96KX0	146 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	CITED4	Q96RK1	184 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	ZMAT4	Q9H898	229 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	GGT3P	A6NGU5	568 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	CD300LB	A8K4G0	201 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	NUDT19	A8MXV4	375 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504		F5H5K5	113 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	GMDS	O60547	372 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	CTLA4	P16410	223 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	AMY2B	P19961	511 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	TGM4	P49221	684 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	CENPA	P49450	140 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	SSX2	Q16385	188 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	OGFOD2	Q6N063	350 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	MICU2	Q8IYU8	434 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	ISOC1	Q96CN7	298 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	DUX3	Q96PT4	197 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC22A4	Q9H015	551 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		5.75	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504		A6NIZ1	184 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504		M0QX08	132 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	LPL	P06858	475 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	CD247	P20963	164 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	GRK5	P34947	590 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	GGT2	P36268	569 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	ERVFRD-1	P60508	538 aa		5.74	□□□□□ -1.49
HDLBP-222	ENST00000449504	RAP1B	P61224	184 aa		5.74	□□□□□ -1.49

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