RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	TBX1	O43435	398 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	GMDS	O60547	372 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SLC2A1	P11166	492 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V1B1	P15313	513 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	HCCS	P53701	268 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	MZT1	Q08AG7	82 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	OR8B8	Q15620	311 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CARTPT	Q16568	116 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	HFE	Q30201	348 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	FAM57B	Q71RH2	274 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SPERT	Q8NA61	448 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	HPS1	Q92902	700 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2F	Q969M7	185 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ERGIC1	Q969X5	290 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	REEP6	Q96HR9	211 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ABCB9	Q9NP78	766 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	FAM206A	Q9NX38	181 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241		J3QRE1	110 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	KRT8	P05787	483 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	COL8A2	P25067	703 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	GATA4	P43694	442 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	FAM3A	P98173	230 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	RAB40B	Q12829	278 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF691	Q5VV52	312 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	KRT74	Q7RTS7	529 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	OR5AS1	Q8N127	324 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	YIPF5	Q969M3	257 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SGK3	Q96BR1	496 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	RNFT2	Q96EX2	444 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	TIMD4	Q96H15	378 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	12.41	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	HIVEP2	P31629	2446 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN25	C9JDP6	229 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241		H0YHG0	523 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CAPG	P40121	348 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CD200	P41217	278 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	CHN2	P52757	468 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	RIPK1	Q13546	671 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	VCX3B	Q9H321	246 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241		R4GMQ9	66 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	ZAN	Q9Y493	2812 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PTPA-222	ENST00000445241	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	IRGM	A1A4Y4	181 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	METTL15	A6NJ78	407 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	PRR32	B1ATL7	298 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	MLNR	O43193	412 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	FSTL3	O95633	263 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	HEXA	P06865	529 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	ANOS1	P23352	680 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	GSK3A	P49840	483 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	ISL1	P61371	349 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	ACTA2	P62736	377 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	ACTG2	P63267	376 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF91	Q05481	1191 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	OR8G1	Q15617	311 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL22	Q53GT1	634 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PTPA-222	ENST00000445241	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		12.39	□□□□□ -0.43

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