RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.77□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELOVL7A1L3X0 281 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 A8MV72 311 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXCR6O00574 342 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 VCYO14598 125 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMCC2O75069 709 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRLF1O75462 422 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRMUO75648 421 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBL3O95164 117 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5F1O95221 314 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 FARS2O95363 451 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 BCL10O95999 233 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLPTM1O96005 669 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MT-ATP6P00846 226 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MT-ND1P03886 318 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST1H2ABP04908 130 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNW1P05000 195 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 QDPRP09417 244 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSF3P09919 207 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASAH2BP0C7U1 165 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 COX4I1P13073 169 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAOP14920 347 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CBR1P16152 277 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACADSP16219 412 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A16P16260 332 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 GABRB1P18505 474 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPR2P20594 1047 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 USF1P22415 310 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARR3P36575 388 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMB10P40306 273 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MDH1P40925 334 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMTP48728 403 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSK3BP49841 420 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPOXP50336 477 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAP3P51398 398 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFNA4P52798 201 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSF2Q03933 536 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM154Q6P9G4 183 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC80Q76M96 950 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SKA3Q8IX90 412 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 NRMQ8IXM6 262 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM86B1Q8N7N1 296 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC30A7Q8NEW0 376 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR4F15Q8NGB8 312 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR51A7Q8NH64 312 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SGCDQ92629 289 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST1H2ACQ93077 130 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM54Q969K7 222 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCHR2Q969V1 340 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RASD2Q96D21 266 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELMOD3Q96FG2 381 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF583Q96ND8 569 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF426Q9BUY5 554 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH20Q9HBT6 801 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 INIPQ9NRY2 104 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 GID8Q9NWU2 228 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAS2R5Q9NYW4 299 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADA2Q9NZK5 511 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIMS3Q9UJD0 308 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 MED31Q9Y3C7 131 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 GMEB1Q9Y692 573 aa3.76□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF212BA8MTL3 300 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC42EP2O14613 210 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IMPA2O14732 288 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDE5AO76074 875 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNA14P01570 189 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR8G3PP0DMU2 310 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF32P17041 273 aa3.75□□□□□ -1.81
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMO1P25800 156 aa3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms