RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR4X1	Q8NH49	305 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM106A	Q96A25	262 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR2AG2	A6NM03	316 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HCRTR2	O43614	444 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM33	P57088	247 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLDN2	P57739	230 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC35A1	P78382	337 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NFATC4	Q14934	902 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM189A2	Q15884	450 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM239	Q8WW34	195 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOTCH4	Q99466	2003 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPTB	P11277	2137 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C20orf202	A1L168	122 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBX19	O60806	448 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRH1	P02810	166 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SERPINA2	P20848	420 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FCGR2C	P31995	323 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAF10	Q12962	218 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF429	Q86V71	674 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSLP	Q969D9	159 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR34	Q96EX3	536 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SGPP1	Q9BX95	441 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MSL2	Q9HCI7	577 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRFN1	Q9P244	771 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VAX2	Q9UIW0	290 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR45	Q9Y484	360 aa		9.35	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A1B0GVT2	93 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HIDE1	A8MVS5	230 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SCGB1D1	O95968	90 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HPRT1	P00492	218 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CKM	P06732	381 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNFSF10	P50591	281 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	H3F3A	P84243	136 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPM6B	Q13491	265 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAB11B	Q15907	218 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF128	Q8TEB7	428 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAB18	Q9NP72	206 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPEG	Q15772	3267 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CBY3	A6NI87	242 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMPRSS11D	O60235	418 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DOK2	O60496	412 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FUT3	P21217	361 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BSG	P35613	385 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTTG1IP	P53801	180 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCL20	P78556	96 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL10A1	Q03692	680 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		9.34	□□□□□ -0.91
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91

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