RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 TMEM9BQ9NQ34 198 aa3.01□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 REREQ9P2R6 1566 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 HIDE1A8MVS5 230 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 MED6O75586 246 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 HPRT1P00492 218 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 RETP07949 1114 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 ADRB3P13945 408 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 GFAPP14136 432 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 FOLR1P15328 257 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 RAB3BP20337 219 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 ARR3P36575 388 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 CFHR2P36980 270 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 SPAM1P38567 509 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 NBL1P41271 181 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 RAB7AP51149 207 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 MXD1Q05195 221 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 SMARCB1Q12824 385 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 ART3Q13508 389 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 TSC22D1Q15714 1073 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 GABRA6Q16445 453 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 ZSCAN26Q16670 478 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 HORMAD1Q86X24 394 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
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TRPS1-204ENST00000422939 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 OR51F2Q8NH61 342 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 RCN3Q96D15 328 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 SMIM10Q96HG1 83 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 RNF170Q96K19 258 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 TSSK3Q96PN8 268 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 FAM49BQ9NUQ9 324 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 PCYOX1Q9UHG3 505 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 GMEB1Q9Y692 573 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 PIEZO1Q92508 2521 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 ABCC5O15440 1437 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 ABCA6Q8N139 1617 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa3□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
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TRPS1-204ENST00000422939 PRSS37A4D1T9 235 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 A6NDN8 102 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 PEX7O00628 323 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 CETN3O15182 167 aa2.99□□□□□ -1.93
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TRPS1-204ENST00000422939 AQP8O94778 261 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 TDP2O95551 362 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 YEATS4O95619 227 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 PSMC3P17980 439 aa2.99□□□□□ -1.93
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TRPS1-204ENST00000422939 C5orf64Q2M2E5 130 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 FRMPD2BQ6IN97 320 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 WDR82Q6UXN9 313 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 NPSR1Q6W5P4 371 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 C12orf54Q6X4T0 127 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 TEX43Q6ZNM6 134 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF621Q6ZSS3 439 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 PID1Q7Z2X4 250 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
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TRPS1-204ENST00000422939 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
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TRPS1-204ENST00000422939 UGT1A7Q9HAW7 530 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 UGT1A8Q9HAW9 530 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 PRSS16Q9NQE7 514 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF302Q9NR11 478 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 CCL28Q9NRJ3 127 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 SLC39A1Q9NY26 324 aa2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa2.99□□□□□ -1.93
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TRPS1-204ENST00000422939 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
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TRPS1-204ENST00000422939 ABCC3O15438 1527 aa2.98□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa2.98□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 HIVEP2P31629 2446 aa2.98□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 A0A096LNJ9 63 aa2.98□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa2.98□□□□□ -1.93
TRPS1-204ENST00000422939 CIB4A0PJX0 185 aa2.98□□□□□ -1.93
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