RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 ISOC1Q96CN7 298 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR14A2Q96R54 314 aa14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPRXA6NFQ7 191 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 UCHL1P09936 223 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM157BP0CG42 384 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIR2DL3P43628 341 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 BSPH1Q075Z2 132 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 BEX5Q5H9J7 111 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PGAP1Q75T13 922 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM106AQ96A25 262 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 C10orf35Q96D05 121 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RADILQ96JH8 1075 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 DERL3Q96Q80 235 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 V9GYS6 101 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC22A1O15245 554 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGFBP2P18065 325 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP2K3P46734 347 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOX2P48431 317 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSK3AP49840 483 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM3AP98173 230 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 INSL4Q14641 139 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR8B8Q15620 311 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 C22orf42Q6IC83 251 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUP37Q8NFH4 326 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCTD7Q96MP8 289 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CENPOQ9BU64 300 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR51B6Q9H340 312 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTTG3PQ9NZH4 202 aa14.6□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCD4O14678 606 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAC2P15153 192 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDOSTP39656 456 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINA12Q8IW75 414 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM222BQ8WU58 562 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOX4Q9NPH5 578 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CKLFQ9UBR5 152 aa14.59□□□□□ -0.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BMQ9 156 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BSH0 61 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CD3EP07766 207 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SELEP16581 610 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF20P17024 532 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLRXP35754 106 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 VBP1P61758 197 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC22A25Q6T423 547 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A40Q8TBP6 338 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGGYQ96C11 551 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOX7Q9BT81 388 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 POFUT1Q9H488 388 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 ESPL1Q14674 2120 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 GGT3PA6NGU5 568 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 FSTP19883 344 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYL9P24844 172 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.1 ms