RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 FADS2O95864 444 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 GABRB1P18505 474 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 USF1P22415 310 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 NR4A2P43354 598 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SRP9P49458 86 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MMP16P51512 607 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 IL5RAQ01344 420 aa13.08□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 Q71RC1 249 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 KLBQ86Z14 1044 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 FTMTQ8N4E7 242 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SGK3Q96BR1 496 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 REEP6Q96HR9 211 aa13.08□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 TBX5Q99593 518 aa13.08□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa13.07□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 IFNL4K9M1U5 179 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMD9O00233 223 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 GMDSO60547 372 aa13.07□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 APOL3O95236 402 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 TACSTD2P09758 323 aa13.07□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 GFOD2Q3B7J2 385 aa13.07□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 ACBD7Q8N6N7 88 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 YIPF7Q8N8F6 280 aa13.07□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 TIMD4Q96H15 378 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ADI1Q9BV57 179 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MOB1AQ9H8S9 216 aa13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 IRGMA1A4Y4 181 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 METTL15A6NJ78 407 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 LYNX1G3V0Z9 82 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 H0YJX3 145 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 LYNX1P0DP58 116 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 DBTP11182 482 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 RAB40BQ12829 278 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 RIN1Q13671 783 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 OR8G1Q15617 311 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHL22Q53GT1 634 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF691Q5VV52 312 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM220AQ7Z4H9 259 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa13.06□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 EGFL6Q8IUX8 553 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 OR56B2PQ8NGI1 322 aa13.06□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 SMR3AQ99954 134 aa13.06□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 BPESC1Q9GZL8 116 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 INPP5EQ9NRR6 644 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM206AQ9NX38 181 aa13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 SNX5Q9Y5X3 404 aa13.06□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GWJ7 208 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 C5orf63A6NC05 138 aa13.05□□□□□ -0.32
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PGGT1B-202ENST00000379615 RP2O75695 350 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 HEXAP06865 529 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP6V1B1P15313 513 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 GNALP38405 381 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 GSK3AP49840 483 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 CHN2P52757 468 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF91Q05481 1191 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 RIPK1Q13546 671 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 BCL2L15Q5TBC7 163 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 COMMD2Q86X83 199 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 RFLNBQ8N5W9 214 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 OR8B12Q8NGG6 310 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB1CQ92928 201 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 YIPF5Q969M3 257 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 LGALS12Q96DT0 336 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2V2Q96R30 315 aa13.05□□□□□ -0.32
PGGT1B-202ENST00000379615 PBOV1Q9GZY1 135 aa13.05□□□□□ -0.32
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