RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 OR5AK2Q8NH90 309 aa25.5■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa25.5■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 SMPD2O60906 423 aa25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 PNPP00491 289 aa25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 PLAUP00749 431 aa25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 LCATP04180 440 aa25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 ANOS1P23352 680 aa25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 MMP16P51512 607 aa25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 UCP2P55851 309 aa25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 FAM206AQ9NX38 181 aa25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 SPEF1Q9Y4P9 236 aa25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 BAHCC1Q9P281 2608 aa25.49■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 SHISA9B4DS77 424 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 COLCA1Q6ZS62 124 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 FAM57BQ71RH2 274 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 PRSS45Q7RTY3 260 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 CATSPERDQ86XM0 798 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 PRSS35Q8N3Z0 413 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM204Q9BSN7 226 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 COMMD4Q9H0A8 199 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 TBCCD1Q9NVR7 557 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 POU2F3Q9UKI9 436 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 RAD52P43351 418 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 SNAI3Q3KNW1 292 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 ACSM3Q53FZ2 586 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00299Q6ZSB3 139 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 A3GALT2U3KPV4 340 aa25.48■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa25.47■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 WDR38Q5JTN6 314 aa25.47■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa25.47■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 STARD10Q9Y365 291 aa25.47■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 ATP23Q9Y6H3 246 aa25.47■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 C5orf63A6NC05 138 aa25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 CLPXO76031 633 aa25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 GOSR1O95249 250 aa25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 SOX6P35712 828 aa25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 OR1J1Q8NGS3 322 aa25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 THRSPQ92748 146 aa25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 NEUROG1Q92886 237 aa25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 BCL2L14Q9BZR8 327 aa25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 MOB1AQ9H8S9 216 aa25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 DCHS2Q6V1P9 2916 aa25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 KIR3DL2P43630 455 aa25.45■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 ERVS71-1P61550 626 aa25.45■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 ZMAT1Q5H9K5 638 aa25.45■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 CEACAM19Q7Z692 300 aa25.45■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 NUP37Q8NFH4 326 aa25.45■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 PGAM5Q96HS1 289 aa25.45■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 SP140LQ9H930 580 aa25.45■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF319Q9P2F9 582 aa25.45■■□□□ 1.67
ECHS1-201ENST00000368547 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 J3QW42 95 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 TBX1O43435 398 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 RPS19P39019 145 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 MTNR1BP49286 362 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1CBP62140 327 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 INSL4Q14641 139 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 VHLLQ6RSH7 139 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF676Q8N7Q3 588 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 OR52H1Q8NGJ2 320 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R14AQ96A00 147 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 PBOV1Q9GZY1 135 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 G6PC2Q9NQR9 355 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 OR52A1Q9UKL2 312 aa25.45■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 FAM221AA4D161 298 aa25.44■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 ARL6IP5O75915 188 aa25.44■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 CDRT1O95170 752 aa25.44■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 UCHL1P09936 223 aa25.44■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA46Q5T0L3 261 aa25.44■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 OR8B12Q8NGG6 310 aa25.44■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 POFUT1Q9H488 388 aa25.44■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 CXorf56Q9H5V9 222 aa25.44■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa25.43■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 ACOD1A6NK06 481 aa25.43■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 ISG15P05161 165 aa25.43■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 SDC2P34741 201 aa25.43■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 GLRXP35754 106 aa25.43■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 BCL2L15Q5TBC7 163 aa25.43■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 OR5L1Q8NGL2 311 aa25.43■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 OR13C5Q8NGS8 318 aa25.43■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A46Q96AG3 418 aa25.43■■□□□ 1.66
ECHS1-201ENST00000368547 CA10Q9NS85 328 aa25.43■■□□□ 1.66
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