RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365490.1

RN7SKP249-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 249, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP249, Length 355 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 DOK3Q7L591 496 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR51A4Q8NGJ6 313 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR1J1Q8NGS3 322 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR10AC1Q8NH08 325 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 PHYHIPQ92561 330 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMEM203Q969S6 136 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 HAVCR1Q96D42 359 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 REEP6Q96HR9 211 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 SOX7Q9BT81 388 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMED9Q9BVK6 235 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 POFUT1Q9H488 388 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 STUB1Q9UNE7 303 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 V9GYS6 101 aa8.4□□□□□ -1.06
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A1B0GVI7 797 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM221AA4D161 298 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 DPPA5A6NC42 116 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 A6NHS1 94 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 SHISA9B4DS77 424 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF879B4DU55 563 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 TBX1O43435 398 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 SYT7O43581 403 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 DHRS3O75911 302 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 GOSR1O95249 250 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ATE1O95260 518 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 CLDN1O95832 211 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 SERPINA3P01011 423 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 RAF1P04049 648 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 CD3EP07766 207 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 RAC2P15153 192 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF250P15622 560 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 GSK3AP49840 483 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 CTF1Q16619 201 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ODF4Q2M2E3 257 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 Q499Y3 187 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR2AE1Q8NHA4 323 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 THRSPQ92748 146 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 C10orf35Q96D05 121 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR51E2Q9H255 320 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 BATF3Q9NR55 127 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.39□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 A0A1B0GWJ7 208 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 GABRPO00591 440 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 PIN1P1O15428 100 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ALX3O95076 343 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 GABARAPO95166 117 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 UCHL1P09936 223 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 KITLGP21583 273 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ACKR3P25106 362 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 THBS4P35443 961 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 DDOSTP39656 456 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 MAGEB1P43366 347 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 MAP2K3P46734 347 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMBIM6P55061 237 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ERVS71-1P61550 626 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 PSG7Q13046 419 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 INSL4Q14641 139 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 MSMPQ1L6U9 139 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 GPR107Q5VW38 600 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 TMEM42Q69YG0 159 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ADAM5Q6NVV9 412 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF529Q6P280 563 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 PAMR1Q6UXH9 720 aa8.38□□□□□ -1.07
RN7SKP249-201ENST00000365490 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.4 ms