RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 M0R135 149 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PHYHO14832 338 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MLNRO43193 412 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PLPP2O43688 288 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LCATP04180 440 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SPARCP09486 303 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SELEP16581 610 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SLC6A9P48067 706 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TPTEP56180 551 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 BTG1P62324 171 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MALLQ13021 153 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SCGB2A2Q13296 93 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZMYND11Q15326 602 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TAF13Q15543 124 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PCK2Q16822 640 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.46□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 TTC23Q5W5X9 447 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf73Q69YU5 71 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CPOQ8IVL8 374 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SPICQ8N5J4 248 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RFLNBQ8N5W9 214 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR8G5Q8NG78 346 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ST7LQ8TDW4 575 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ITFG2Q969R8 447 aa6.46□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF799Q96GE5 643 aa6.46□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.46□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OPA3Q9H6K4 179 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 NIPAL2Q9H841 368 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MARCH7Q9H992 704 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 GCM1Q9NP62 436 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.46□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.46□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.46□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 FAM183AA6NL82 134 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF878C9JN71 531 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 F5H5P2 479 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 H0YJX3 145 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 H0YL77 283 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 J3QLI3 93 aa6.45□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 TCF21O43680 179 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 CLUP10909 449 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 IL18R1Q13478 541 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 APOFQ13790 326 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SNCBQ16143 134 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.45□□□□□ -1.38
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SGMS1-201ENST00000361543 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DRAM2Q6UX65 266 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PGAP1Q75T13 922 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 NAA40Q86UY6 237 aa6.45□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.45□□□□□ -1.38
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