RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 NR2C1P13056 603 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXC12P31275 282 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS3P35030 304 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 DNASE1L1P49184 302 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 PTH2RP49190 550 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 CCR6P51684 374 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 DLX5P56178 289 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 GMFBP60983 142 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM189A2Q15884 450 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ACKR1Q16570 336 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 MEP1BQ16820 701 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TEX30Q5JUR7 227 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SPINK14Q6IE38 97 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD16Q6P6B7 361 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 CBLN3Q6UW01 205 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 APOOLQ6UXV4 268 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH26Q8IXH8 852 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 PRR22Q8IZ63 422 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 MDS2Q8NDY4 140 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NUBPLQ8TB37 319 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF519Q8TB69 540 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ASB5Q8WWX0 329 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM106AQ96A25 262 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 MBD6Q96DN6 1003 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 RBP7Q96R05 134 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 POTEKPQ9BYX7 375 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 GSX2Q9BZM3 304 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 DUX4Q9UBX2 424 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 HHLA2Q9UM44 414 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 NPTNQ9Y639 398 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 ARID1AO14497 2285 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GTH9 108 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2W5A6NFC9 320 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 GGT3PA6NGU5 568 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 IDSB3KWA1 339 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 H7C1Q1 480 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMD9O00233 223 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC16A7O60669 478 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 ICMTO60725 284 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 TSC22D2O75157 780 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 NPIPB7O75200 414 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 RGS11O94810 467 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFB6O95139 128 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 ONECUT2O95948 504 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 HRGP04196 525 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 SPARCP09486 303 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 TFPIP10646 304 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF24P17028 368 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 FSTP19883 344 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 PTGS2P35354 604 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 CD96P40200 585 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 RFC3P40938 356 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 EFNA3P52797 238 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 PUDPQ08623 228 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 PMPCAQ10713 525 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 IKZF1Q13422 519 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1C1Q15619 314 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf183Q5T699 404 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB12Q6IQ22 244 aa6.21□□□□□ -1.42
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