RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 ID2Q02363 134 aa9.66□□□□□ -0.86
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KPNA3-201ENST00000261667 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.66□□□□□ -0.86
KPNA3-201ENST00000261667 C12orf73Q69YU5 71 aa9.66□□□□□ -0.86
KPNA3-201ENST00000261667 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.66□□□□□ -0.86
KPNA3-201ENST00000261667 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.66□□□□□ -0.86
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KPNA3-201ENST00000261667 KCNJ15Q99712 375 aa9.66□□□□□ -0.86
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KPNA3-201ENST00000261667 OR10G6Q8NH81 332 aa9.66□□□□□ -0.86
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KPNA3-201ENST00000261667 Q9N2J8 555 aa9.66□□□□□ -0.86
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KPNA3-201ENST00000261667 STAC2Q6ZMT1 411 aa9.65□□□□□ -0.86
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KPNA3-201ENST00000261667 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.65□□□□□ -0.87
KPNA3-201ENST00000261667 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.65□□□□□ -0.87
KPNA3-201ENST00000261667 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.65□□□□□ -0.87
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KPNA3-201ENST00000261667 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa9.65□□□□□ -0.87
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KPNA3-201ENST00000261667 SPACA7Q96KW9 195 aa9.64□□□□□ -0.87
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KPNA3-201ENST00000261667 H2BFSP57053 126 aa9.64□□□□□ -0.87
KPNA3-201ENST00000261667 ZP1P60852 638 aa9.64□□□□□ -0.87
KPNA3-201ENST00000261667 AESQ08117 197 aa9.64□□□□□ -0.87
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