RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 MICU2Q8IYU8 434 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OFCC1Q8IZS5 231 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 BEND2Q8NDZ0 799 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OR2T12Q8NG77 320 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OR8G5Q8NG78 346 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OR13G1Q8NGZ3 307 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 BPIFA2Q96DR5 249 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SIRT7Q9NRC8 400 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV27A0A087WT01 109 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GWJ7 208 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ELOVL7A1L3X0 281 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 J3KTA2 159 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ADAM20O43506 726 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CHST1O43916 411 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CST2P09228 141 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 LAP3P28838 519 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CTXN1P60606 82 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SELENOWP63302 87 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 GUCA2AQ02747 115 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 C11orf91Q3C1V1 193 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 VTCN1Q7Z7D3 282 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 NRMQ8IXM6 262 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PTP4A1Q93096 173 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TPD52L3Q96J77 140 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 MAP6Q96JE9 813 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF702PQ9H963 129 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CMTM6Q9NX76 183 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 POMPQ9Y244 141 aa13.36□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PRD5 423 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PRF3 423 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PRM7 423 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 HTR3EA5X5Y0 456 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FAM20BO75063 409 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SCG5P05408 212 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 IRF2P14316 349 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 YAP1P46937 504 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 DLX1P56177 255 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 KLRD1Q13241 179 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FLOT2Q14254 428 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OR2T2Q6IF00 324 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 Q8N2B8 174 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PNKDQ8N490 385 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FAM156AQ8NDB6 213 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OR13C2Q8NGS9 318 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SSX3Q99909 188 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 RAB18Q9NP72 206 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 RHCGQ9UBD6 479 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 AP3M1Q9Y2T2 418 aa13.35□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 MEIOCA2RUB1 952 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 H7C1C5 153 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CDC42EP2O14613 210 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ECDO95905 644 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 COX5BP10606 129 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 MSR1P21757 451 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SLC7A2P52569 658 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 RAD23AP54725 363 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PCBD1P61457 104 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 LCN6P62502 163 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PRKCDQ05655 676 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 MAB21L1Q13394 359 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 RCN1Q15293 331 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 KCNJ8Q15842 424 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 OR51A7Q8NH64 312 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FNDC8Q8TC99 324 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SLC7A13Q8TCU3 470 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 LRGUKQ96M69 825 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 POLE4Q9NR33 117 aa13.34□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WUU8 490 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PPL8 197 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1W2PRX2 142 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 A6NIZ1 184 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LGALS8O00214 317 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 KRT36O76013 467 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ZFPL1O95159 310 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 PF4V1P10720 104 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RAP1BP61224 184 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 RAP1AP62834 184 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TRAM2Q15035 370 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 MESTQ5EB52 335 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FBXW12Q6X9E4 464 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 FAM122BQ7Z309 247 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 OAFQ86UD1 273 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 SLC15A3Q8IY34 581 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 OR11L1Q8NGX0 322 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf50Q8WW18 174 aa13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
SPCS1-201ENST00000233025 TNFRSF14Q92956 283 aa13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms