RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046095.9

Vsx1-201, Transcript of Visual system homeobox 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vsx1, Length 3,791 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Plpp1Q61469 283 aa11.36□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 NrrosQ8BMT4 693 aa11.36□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Defb22Q8BVC1 179 aa11.36□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Aqp3Q8R2N1 292 aa11.36□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr995Q8VF74 315 aa11.36□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr676Q8VGZ9 317 aa11.36□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ppa1Q9D819 289 aa11.36□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Slc48a1Q9D8M3 146 aa11.36□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 C1galt1c1Q9JMG2 316 aa11.36□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 BC025446A0A087WQT1 134 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dhrs9Q58NB6 319 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Nufip2Q5F2E7 692 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Irgm1Q60766 409 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mc2rQ64326 296 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Svs6Q64356 99 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 March1Q6NZQ8 289 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ccdc36Q6PDM4 574 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cdhr3Q8BL00 831 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 March11Q8CBH7 400 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rdh16f2Q8K3M1 318 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr47Q8VF18 321 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tram1Q91V04 374 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Flvcr2Q91X85 551 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dnttip1Q99LB0 328 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ptp4a3Q9D658 173 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr944Q9EQ91 311 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 ClnkQ9QZE2 435 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Trbv23A0A0A6YWQ1 115 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr239A0PK55 315 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm15446D3Z5Y8 553 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Vmn1r88E9Q235 316 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr55K7N6Q1 315 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmem178bM0QWJ9 172 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 VegfcP97953 415 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cd80Q00609 306 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rspo3Q2TJ95 277 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fahd2Q3TC72 313 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fndc4Q3TR08 231 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mmp25Q3U435 615 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Bbs12Q5SUD9 708 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Anapc10Q8K2H6 185 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ubac2Q8R1K1 345 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fitm1Q91V79 292 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Xrcc2Q9CX47 278 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Elovl7Q9D2Y9 281 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Elp4Q9ER73 422 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sema7aQ9QUR8 664 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Iglc4A0A0G2JEK5 104 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp433A0A0J9YUD4 600 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm32687A0A1W2P6H7 600 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ldlrad1D3YYZ1 218 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr568E9Q554 313 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Galr3O88853 370 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 P03976 113 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Il5P04401 133 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 HexaP29416 528 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rab6aP35279 208 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lsm5P62322 91 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Prss57Q14B24 284 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Nhlrc4Q3UP44 136 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp157Q6PCM4 567 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rsl1Q7M6Y1 485 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1357Q7TQU7 313 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sult1c1Q80VR3 304 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 2810021J22RikQ8BIB6 539 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 4922502D21RikQ8C634 189 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sdhaf2Q8C6I2 164 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Katnal1Q8K0T4 488 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Vmn1r208Q8R275 308 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1238Q8VG59 315 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ubox5Q925F4 539 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cdca5Q9CPY3 264 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Nol3Q9D1X0 220 aa11.35□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 FggyA2AJL3 552 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Saxo1B1AXP3 476 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp988F6VKC7 633 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm5798F7BTS7 198 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm5458L7N219 204 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Doc2bP70169 412 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Txnl1Q8CDN6 289 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 CenpoQ8K015 298 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1424Q8VFV1 313 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sntb1Q99L88 537 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ints12Q9D168 461 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dmrt1Q9QZ59 374 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Plxna3P70208 1872 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fer1l5P0DM40 2038 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr1223A0A1L1SU13 311 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm13762A2ATG2 311 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp870J3QMA4 560 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr889L7N1Y6 314 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 RaxO35602 342 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 CtssO70370 340 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 AF067061O70616 171 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sox18P43680 377 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 EbpP70245 230 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Psg26Q4KL65 475 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Hormad2Q5SQP1 306 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Selenbp2Q63836 472 aa11.34□□□□□ -0.59
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Olfr259Q7TS20 312 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.5 ms