RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A4Q9H015 551 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 NRIP3Q9NQ35 241 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 AURKCQ9UQB9 309 aa22.56■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ECDO95905 644 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GGT2P36268 569 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 POU4F2Q12837 409 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP77Q6ZQR2 320 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZTK2 550 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ATF6BQ99941 703 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTD2Q9H8S5 307 aa22.55■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PRD5 423 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PRF3 423 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PRM7 423 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN9O75954 239 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GRPP07492 148 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 MDH1P40925 334 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS6KA3P51812 740 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CDONQ4KMG0 1287 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 IFI44LQ53G44 452 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZPA2 131 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP9P1Q75LS8 142 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 NAA40Q86UY6 237 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNRD1Q9P1U0 126 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SIGLEC7Q9Y286 467 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 KPTNQ9Y664 436 aa22.54■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GVI7 797 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GGT3PA6NGU5 568 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CD300LBA8K4G0 201 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TGFBR2P37173 567 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ECH1Q13011 328 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF826PQ6ZT77 177 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4Z1Q86W10 505 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A1Q86YD7 464 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SIRT7Q9NRC8 400 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GID8Q9NWU2 228 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJB11Q9UBS4 358 aa22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 BBIP1A8MTZ0 92 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 DCTN6O00399 190 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GMDSO60547 372 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 PAHP00439 452 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 NPPAP01160 153 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TPTEP56180 551 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 HERPUD1Q15011 391 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 COQ5Q5HYK3 327 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL21CQ5VZV1 264 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GALNT4Q8N4A0 578 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 PPA2Q9H2U2 334 aa22.52■■□□□ 1.2
CAPNS1-217ENST00000629983 PTP4A3O75365 173 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DQA2P01906 255 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 OPN1MWP04001 364 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 OPN1MW2P0DN77 364 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 OPN1MW3P0DN78 364 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 GABRA5P31644 462 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC36A3Q495N2 470 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FGD3Q5JSP0 725 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC18B1Q6NT16 456 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CMTM4Q8IZR5 234 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 LNX2Q8N448 690 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PLPP7Q8NBV4 271 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 B9D1Q9UPM9 204 aa22.51■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD5Q5TGI4 173 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 REC114Q7Z4M0 266 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FGFRL1Q8N441 504 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 GCSAMQ8N6F7 178 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf44Q8N8P7 122 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC26A10Q8NG04 563 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC7A13Q8TCU3 470 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MRAPQ8TCY5 172 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 HSH2DQ96JZ2 352 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD19PQ9H560 264 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R135 149 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FCN3O75636 299 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R3DO95685 299 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 RENP00797 406 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 GUCA2AQ02747 115 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPRE2Q15555 327 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf91Q3C1V1 193 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35E4Q6ICL7 350 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2AE1Q8NHA4 323 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 NPRL2Q8WTW4 380 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF799Q96GE5 643 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
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