RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SFXN4Q6P4A7 337 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 COLCA1Q6ZS62 124 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZSR3 168 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 C17orf78Q8N4C9 275 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 AP3S1Q92572 193 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 POM121L2Q96KW2 1035 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 DMRTA2Q96SC8 542 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 GFI1Q99684 422 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 VKORC1Q9BQB6 163 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 PIGMQ9H3S5 423 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXJ3Q9UPW0 622 aa21.63■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINA5P05154 406 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 INHBBP09529 407 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 ADRA2CP18825 462 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 GFOD2Q3B7J2 385 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 COMMD2Q86X83 199 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 PARP16Q8N5Y8 322 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR31Q8NA23 367 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1J2Q8NGS2 313 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 SGK3Q96BR1 496 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC30A2Q9BRI3 323 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 SMURF1Q9HCE7 757 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 SHANK1Q9Y566 2161 aa21.62■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 NOTOA8MTQ0 251 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF12P17014 697 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 OR14K1Q8NGZ2 314 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 FGGYQ96C11 551 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 PEX16Q9Y5Y5 336 aa21.61■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PR80 420 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 C5orf49A4QMS7 147 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 A8MXE2 369 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 CTDSP2O14595 271 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 EPXP11678 715 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 BMP5P22003 454 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXC12P31275 282 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 CA7P43166 264 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 ATRXP46100 2492 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM211Q6ICI0 200 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC54Q8NEL0 328 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 MS4A3Q96HJ5 214 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R4Q9NYW5 299 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 MEMO1Q9Y316 297 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 V9GYS6 101 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 RTTNQ86VV8 2226 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 MAS1P04201 325 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL2P13500 99 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 APLNRP35414 380 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 THBS2P35442 1172 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 CASP6P55212 293 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 IDNKQ5T6J7 187 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 MRGPRGQ86SM5 289 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINA12Q8IW75 414 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 OBP2BQ9NPH6 170 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 CKLFQ9UBR5 152 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF391Q9UJN7 358 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 V9GY05 133 aa21.6■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 DHRS3O75911 302 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNOP22674 350 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 S100A5P33763 92 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 PEX19P40855 299 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 GLYATL3Q5SZD4 288 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 REEP6Q96HR9 211 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 RGCCQ9H4X1 137 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 AKIP1Q9NQ31 210 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 DAPK2Q9UIK4 370 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 ACACBO00763 2458 aa21.59■■□□□ 1.05
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5H1A6NKK0 313 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 CBR1P16152 277 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 DDOSTP39656 456 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC30A7Q8NEW0 376 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2AE1Q8NHA4 323 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOT12Q8WYK0 555 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 RND1Q92730 232 aa21.58■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 NBEAQ8NFP9 2946 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 SPTA1P02549 2419 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 XRCC2O43543 280 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV3-15P01624 115 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 ATF1P18846 271 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD7P51665 324 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 LIX1LQ8IVB5 337 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 JKAMPQ9P055 326 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 AMDHD2Q9Y303 409 aa21.57■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 A6NIN4 97 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 ANXA2P2A6NMY6 339 aa21.56■■□□□ 1.04
CAPNS1-215ENST00000628018 IFITM5A6NNB3 132 aa21.56■■□□□ 1.04
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