RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618504.4

PDE4DIP-247, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDE4DIP, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-247ENST00000618504 ETV6P41212 452 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 SCAND1P57086 179 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 HIKESHIQ53FT3 197 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 CEP78Q5JTW2 689 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 SFRP5Q5T4F7 317 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 DDI2Q5TDH0 399 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 PGAP1Q75T13 922 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 SSX8Q7RTT4 187 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 LRRTM1Q86UE6 522 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZGRF1Q86YA3 2104 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 SERPINA12Q8IW75 414 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZNF610Q8N9Z0 462 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 OR1J2Q8NGS2 313 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 OR14K1Q8NGZ2 314 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 SLC7A6Q92536 515 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 SPSB4Q96A44 273 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZNF75AQ96N20 296 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 OR10A4Q9H209 315 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 GPR84Q9NQS5 396 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 TINAGQ9UJW2 476 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 V9GY05 133 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 V9GYS6 101 aa9.6□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 A0A1W2PPK0 400 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ANXA2P2A6NMY6 339 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 CLDN25C9JDP6 229 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ALX3O95076 343 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 IGKV3-15P01624 115 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 LCATP04180 440 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 CD37P11049 281 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 EPXP11678 715 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 CBR1P16152 277 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZNF20P17024 532 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 THBS4P35443 961 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 DDOSTP39656 456 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 CA7P43166 264 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 CAPZA1P52907 286 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 PPP3R1P63098 170 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 HGFACQ04756 655 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZNF846Q147U1 533 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 TBC1D28Q2M2D7 210 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 GLT8D1Q68CQ7 371 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZNF529Q6P280 563 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 PCSK4Q6UW60 755 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 MDP1Q86V88 176 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 NR2C2APQ86WQ0 139 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 COMMD2Q86X83 199 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 CMTM3Q96MX0 182 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 PLEKHA1Q9HB21 404 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 NOX3Q9HBY0 568 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ELOVL5Q9NYP7 299 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZNF319Q9P2F9 582 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 CMAHPQ9Y471 501 aa9.59□□□□□ -0.87
PDE4DIP-247ENST00000618504 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 LOC100509620A0A075B734 347 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 A0A0G2JNJ9 132 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 OR5H1A6NKK0 313 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 IFITM5A6NNB3 132 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 A8MXE2 369 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 IL32P24001 234 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 THBS2P35442 1172 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 MAGEB1P43366 347 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 BMXP51813 675 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 CAV3P56539 151 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 OR10A3P58181 314 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZNF45Q02386 682 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 PMPCAQ10713 525 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 LY6DQ14210 128 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 SNAI3Q3KNW1 292 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 TIMM23BQ5SRD1 257 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 IDNKQ5T6J7 187 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 ASPHD2Q6ICH7 369 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 UTS2BQ765I0 119 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 CCDC190Q86UF4 302 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 NAA40Q86UY6 237 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 CDH26Q8IXH8 852 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 WDR31Q8NA23 367 aa9.58□□□□□ -0.88
PDE4DIP-247ENST00000618504 SLC30A7Q8NEW0 376 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms