RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
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CTDP1-208ENST00000613122 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 ZFP64Q9NPA5 681 aa18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 OPRM1P35372 400 aa18.2■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 GON7Q9BXV9 100 aa18.2■□□□□ 0.5
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CTDP1-208ENST00000613122 ST3GAL6Q9Y274 331 aa18.2■□□□□ 0.5
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CTDP1-208ENST00000613122 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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CTDP1-208ENST00000613122 CASP3P42574 277 aa18.18■□□□□ 0.5
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CTDP1-208ENST00000613122 CDK5R1Q15078 307 aa18.18■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 FCN2Q15485 313 aa18.18■□□□□ 0.5
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CTDP1-208ENST00000613122 OR13C8Q8NGS7 320 aa18.18■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 CT55Q8WUE5 264 aa18.18■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
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CTDP1-208ENST00000613122 ONECUT1Q9UBC0 465 aa18.18■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa18.18■□□□□ 0.5
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CTDP1-208ENST00000613122 NKX2-2O95096 273 aa18.18■□□□□ 0.5
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CTDP1-208ENST00000613122 TAAR6Q96RI8 345 aa18.18■□□□□ 0.5
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CTDP1-208ENST00000613122 LAMA4Q16363 1823 aa18.18■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 GPR37O15354 613 aa18.18■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa18.18■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGDIGQ99819 225 aa18.18■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 ATF1P18846 271 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 C2orf76Q3KRA6 126 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 OR13C5Q8NGS8 318 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 THBS4P35443 961 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 CREB3L2Q70SY1 520 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 C5orf67F2Z3F1 127 aa18.17■□□□□ 0.5
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CTDP1-208ENST00000613122 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 OR2G3Q8NGZ4 309 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 BTF3L4Q96K17 158 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 CCSO14618 274 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 ACKR3P25106 362 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF793Q6ZN11 406 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 ADGRG3Q86Y34 549 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 NARFLQ9H6Q4 476 aa18.17■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 SIX6O95475 246 aa18.16■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 FAHP16930 419 aa18.16■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 SPANXN5Q5MJ07 72 aa18.16■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 LINC01555Q8NAE3 123 aa18.16■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 ALG14Q96F25 216 aa18.16■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 TCRBV5S2A0A599 114 aa18.16■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 FCGR2CP31995 323 aa18.16■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 GALMQ96C23 342 aa18.16■□□□□ 0.5
CTDP1-208ENST00000613122 SBK3P0C264 359 aa18.16■□□□□ 0.5
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