RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 MAKP20794 623 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A53Q5H9E4 307 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 WBP2NLQ6ICG8 309 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2A2Q6IF42 318 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 SFXN4Q6P4A7 337 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 GID4Q8IVV7 300 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 PRR18Q8N4B5 295 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 OR52L1Q8NGH7 329 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 DTD1Q8TEA8 209 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 TTTY10Q9BZA0 68 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 CYSLTR2Q9NS75 346 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 GAB2Q9UQC2 676 aa11.02□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0A6YYJ9 748 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 UNC119BA6NIH7 251 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 PTP4A3O75365 173 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 THBS1P07996 1170 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 FCN2Q15485 313 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 OR1Q1Q15612 314 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ELOA3BQ3SY89 546 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 PDSS1Q5T2R2 415 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 WFDC8Q8IUA0 241 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 TIGD4Q8IY51 512 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ELOA3Q8NG57 546 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS27Q9BQR3 290 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 NUDT15Q9NV35 164 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 GJE1A6NN92 205 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 BHLHE40O14503 412 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN4O14817 238 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 FABP7O15540 132 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 SIAH2O43255 324 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 CLUP10909 449 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 THBS2P35442 1172 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ACVR1BP36896 505 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 STAC2Q6ZMT1 411 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ABHD1Q96SE0 405 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 JKAMPQ9P055 326 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC23A1Q9UHI7 598 aa11.01□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 TOR1AO14656 332 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 FCGR2AP12318 317 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 BDH1Q02338 343 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 PLA1AQ53H76 456 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf140Q5VVS0 124 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 CEACAM19Q7Z692 300 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 OAFQ86UD1 273 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC17Q8N6Y2 441 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 CYB561A3Q8NBI2 242 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 OR13C5Q8NGS8 318 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 OR13C2Q8NGS9 318 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 OR5H6Q8NGV6 325 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 TAAR8Q969N4 342 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 IFT27Q9BW83 186 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 JAM3Q9BX67 310 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ACTR6Q9GZN1 396 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 MED13LQ71F56 2210 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV27A0A087WT01 109 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PPK0 400 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 MSTNO14793 375 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 GATCO43716 136 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 CHP2O43745 196 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 CIDEAO60543 219 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 GYPBP06028 91 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 SAGP10523 405 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 GALP22466 123 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 BTCP35070 178 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 PITPNBP48739 271 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 GUSBP1Q15486 140 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF100Q8IYN0 542 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM239Q8WW34 195 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 HSD17B8Q92506 261 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 PTP4A1Q93096 173 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 S100PBPQ96BU1 408 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 DDIT4LQ96D03 193 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 C4orf36Q96KX1 117 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 MED28Q9H204 178 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAPPC13A5PLN9 417 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 J3QLW9 94 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-209ENST00000607882 RAD51DO75771 328 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms