RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 CYYR1Q96J86 154 aa9.57□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 FBRSQ9HAH7 460 aa9.57□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.57□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 A0A0D9SG52 128 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM235A6NFC5 223 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 SHISA8B8ZZ34 492 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 AP4M1O00189 453 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 AMY2AP04746 511 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 CD1AP06126 327 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 SKP1P63208 163 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 ACY1Q03154 408 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 SLC17A1Q14916 467 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 TGIF1Q15583 401 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 SLC22A6Q4U2R8 563 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 RTN4RL2Q86UN3 420 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 TCTN2Q96GX1 697 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 CMTM3Q96MX0 182 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 ETV7Q9Y603 341 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 FADS1O60427 444 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 IL33O95760 270 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 NR2C1P13056 603 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 DRD1P21728 446 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 CAPZBP47756 277 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 PLCXD2Q0VAA5 305 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 KIAA0895LQ68EN5 471 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 MISP3Q96FF7 219 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 FAM96BQ9Y3D0 163 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 AKAIN1P0CW23 69 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 F2RL1P55085 397 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 LANCL3Q6ZV70 420 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM200AQ86VY9 491 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 WDFY1Q8IWB7 410 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF440Q8IYI8 595 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 ARL11Q969Q4 196 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 MCHR2Q969V1 340 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 OR8B4Q96RC9 309 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 PIGQQ9BRB3 760 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 ABHD6Q9BV23 337 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 PDE7BQ9NP56 450 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 ACKR4Q9NPB9 350 aa9.56□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 PRSS37A4D1T9 235 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 RAB3DO95716 219 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 CPT2P23786 658 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 AVPR2P30518 371 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 PPICP45877 212 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 ISXQ2M1V0 245 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 TMEM225Q6GV28 225 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 C9orf40Q8IXQ3 194 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 OR1J2Q8NGS2 313 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 SPACA5Q96QH8 159 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 EMC6Q9BV81 110 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 LANCL2Q9NS86 450 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 CUTCQ9NTM9 273 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 VDAC3Q9Y277 283 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 LRP12Q9Y561 859 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 NBASA2RRP1 2371 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 A6NLC8 198 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 BCL2L11O43521 198 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 CSF1P09603 554 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 ARL4DP49703 201 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 GFOD2Q3B7J2 385 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 EID2Q8N6I1 236 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 CHST4Q8NCG5 386 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 RAB3CQ96E17 227 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.55□□□□□ -0.88
FCHO1-216ENST00000596536 LAT2Q9GZY6 243 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms