RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SRMP19623 302 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX2P48431 317 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZSR3 168 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 PLPP7Q8NBV4 271 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 OR13C3Q8NGS6 347 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10A4Q9H209 315 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR84Q9NQS5 396 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ESPL1Q14674 2120 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 J3QW42 95 aa26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 PIN1P1O15428 100 aa26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 TBX1O43435 398 aa26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV3-15P01624 115 aa26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 TSC22D1Q15714 1073 aa26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 TBC1D28Q2M2D7 210 aa26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00299Q6ZSB3 139 aa26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SSX8Q7RTT4 187 aa26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 TSC22D3Q99576 134 aa26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 C5orf49A4QMS7 147 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 PDCD5O14737 125 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 XRCC2O43543 280 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CFL1P23528 166 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 HGFACQ04756 655 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 MXD1Q05195 221 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC30A7Q8NEW0 376 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 TCF7L1Q9HCS4 588 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXJ3Q9UPW0 622 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 NBEAQ8NFP9 2946 aa26.94■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 SHISA3A0PJX4 238 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 FSTP19883 344 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF404Q494X3 552 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 COMMD2Q86X83 199 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 TPK1Q9H3S4 243 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CKLFQ9UBR5 152 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PPK0 400 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 DHRS7CA6NNS2 312 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CLPXO76031 633 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB3BP20337 219 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 MAGEB1P43366 347 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAI3Q3KNW1 292 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 C3orf36Q3SXR2 165 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 LIX1LQ8IVB5 337 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 PARP16Q8N5Y8 322 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT11Q8NCW6 608 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 C10orf35Q96D05 121 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP27Q9H306 513 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A15Q9Y619 301 aa26.93■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GUH1 482 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 ICMTO60725 284 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM127O75204 238 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 COQ3Q9NZJ6 369 aa26.92■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 DHRS3O75911 302 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CHRNB4P30926 498 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMD7P51665 324 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 MTFR2Q6P444 385 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINA12Q8IW75 414 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 MCFD2Q8NI22 146 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 AP3S1Q92572 193 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 SGK3Q96BR1 496 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 MUCL1Q96DR8 90 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 TBCCD1Q9NVR7 557 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A075B6Q4 140 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV1-44P01699 117 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CLEC2LP0C7M8 214 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CCNOP22674 350 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 LSAMPQ13449 338 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 OR14K1Q8NGZ2 314 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 SPSB4Q96A44 273 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 S100PBPQ96BU1 408 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 MS4A3Q96HJ5 214 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 REEP6Q96HR9 211 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 OPA3Q9H6K4 179 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 V9GYS6 101 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PR80 420 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BSH0 61 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 GFOD2Q3B7J2 385 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 LYZL4Q96KX0 146 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 BARHL1Q9BZE3 327 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH20Q9HBT6 801 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-206ENST00000588815 C16orf97H3BN30 126 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ANOS1P23352 680 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 ASCL1P50553 236 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5L1Q8NGL2 311 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5D14Q8NGL3 314 aa26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms