RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	HNMT	P50135	292 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RAB13	P51153	203 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	XK	P51811	444 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	MVD	P53602	400 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TMBIM6	P55061	237 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	KCNJ10	P78508	379 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SLC17A1	Q14916	467 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	KIR2DS1	Q14954	304 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	LIPJ	Q5W064	366 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	FAHD1	Q6P587	224 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SERPINA11	Q86U17	422 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OR7G3	Q8NG95	312 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OR7G2	Q8NG99	324 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OR2T29	Q8NH02	315 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	FNDC8	Q8TC99	324 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF675	Q8TD23	568 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	C17orf50	Q8WW18	174 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	APH1B	Q8WW43	257 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF566	Q969W8	418 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	YIPF6	Q96EC8	236 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	LYZL4	Q96KX0	146 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OR5B2	Q96R09	309 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SH3GL1	Q99961	368 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	DUSP21	Q9H596	190 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	LRP12	Q9Y561	859 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772		U3KQV3	271 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PTGES3L	E9PB15	166 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772		H0YIV9	168 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772		M0QX08	132 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	GNGT2	O14610	69 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PDPK1	O15530	556 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	UGDH	O60701	494 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	E2F6	O75461	281 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	C6orf47	O95873	294 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	FABP3	P05413	133 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ETFA	P13804	333 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	HSD3B1	P14060	373 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PRKCA	P17252	672 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	CCNA2	P20248	432 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	HIST1H2AD	P20671	130 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	HSD3B2	P26439	372 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	OPRL1	P41146	370 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PRIM2	P49643	509 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PSMD7	P51665	324 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZP1	P60852	638 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	IL18R1	Q13478	541 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	RGN	Q15493	299 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	CTF1	Q16619	201 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	DECR1	Q16698	335 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	GSG1	Q2KHT4	349 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MSI2-216	ENST00000582772	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	3.79	□□□□□ -1.8	7e-6	■□□□□ 9.5
MSI2-216	ENST00000582772	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		3.79	□□□□□ -1.8

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