RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561300.1

TMOD2-205, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 2

Gene TMOD2, Length 542 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-205ENST00000561300 PPP1R7Q15435 360 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 NT5DC3Q86UY8 548 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 ERO1BQ86YB8 467 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 CMTM1Q8IZ96 169 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 NECAB1Q8N987 351 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 KCNG3Q8TAE7 436 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 OR51E1Q8TCB6 317 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 ECHDC3Q96DC8 303 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 RNF145Q96MT1 663 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 NEUROG2Q9H2A3 272 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 DCAF16Q9NXF7 216 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 DENND4AQ7Z401 1863 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 ERICH4A6NGS2 130 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 CLOCKO15516 846 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 INAFM2P0DMQ5 153 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 CD28P10747 220 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 SLC1A1P43005 524 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 ART3Q13508 389 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 LUZP6Q538Z0 58 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 C9orf135Q5VTT2 229 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 SLC8B1Q6J4K2 584 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 CMC1Q7Z7K0 106 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 MDP1Q86V88 176 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 TBC1D21Q8IYX1 336 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 SNX31Q8N9S9 440 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 OR2Z1Q8NG97 314 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 GHSRQ92847 366 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 C18orf15Q96N68 181 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 NUDT9Q9BW91 350 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 IL37Q9NZH6 218 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa1.4□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 FHOD3Q2V2M9 1422 aa1.4□□□□□ -2.18
TMOD2-205ENST00000561300 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 TAAR5O14804 337 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 OR7C2O60412 319 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 NMT2O60551 498 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 AQP8O94778 261 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 SNX4O95219 450 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 MT-ND4P03905 459 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 NDUFA8P51970 172 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 CHRNA6Q15825 494 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 PSMD5Q16401 504 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 TMEM69Q5SWH9 247 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 REEP3Q6NUK4 255 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 OTUD6BQ8N6M0 293 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 NRBF2Q96F24 287 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 PKMYT1Q99640 499 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 CENPKQ9BS16 269 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 TAS2R1Q9NYW7 299 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 XKRY2A2RUG3 117 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 SIRPB1O00241 398 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 GATBO75879 557 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 OR2J3O76001 311 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 TCP1P17987 556 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 PEX19P40855 299 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 GZMMP51124 257 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 TRAM2Q15035 370 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 SSX2Q16385 188 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 MAJINQ3KP22 176 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 CEP55Q53EZ4 464 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 OR7G2Q8NG99 324 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 OR1L1Q8NH94 360 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 ACMSDQ8TDX5 336 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 CAPSLQ8WWF8 208 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 ZNF606Q8WXB4 792 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 HAUS1Q96CS2 278 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 CFAP53Q96M91 514 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 STACQ99469 402 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 METTL7AQ9H8H3 244 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 HPCAL4Q9UM19 191 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 R4GN34 69 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa1.39□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 J3QKU1 62 aa1.38□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 PRKACBP22694 351 aa1.38□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP1.38□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 CD70P32970 193 aa1.38□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 BMI1P35226 326 aa1.38□□□□□ -2.19
TMOD2-205ENST00000561300 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms