RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551459.5

RAB5B-209, Transcript of RAB5B, member RAS oncogene family, human

TSL 4

Gene RAB5B, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB5B-209	ENST00000551459	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SOCS2	O14508	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC16A7	O60669	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SERPINI2	O75830	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	GLCE	O94923	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RAF1	P04049	648 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	INHBB	P09529	407 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	GABRB1	P18505	474 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PTN	P21246	168 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MSR1	P21757	451 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	FMO3	P31513	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	GGT2	P36268	569 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	HSPA13	P48723	471 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	CD47	Q08722	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	AQP6	Q13520	282 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MELK	Q14680	651 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TAB1	Q15750	504 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	DOK3	Q7L591	496 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	OR4K13	Q8NH42	304 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SYT4	Q9H2B2	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459		A0A1W2PPR1	153 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	DLGAP1	O14490	977 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	PHYH	O14832	338 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	RAD51D	O75771	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	LYZL6	O75951	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SOX14	O95416	240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SNAP29	O95721	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	LY6G6D	O95868	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	APOC1	P02654	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	SERPINA5	P05154	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	HEXA	P06865	529 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	CTLA4	P16410	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	ZNF823	P16415	610 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	TMEM11	P17152	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	EDNRA	P25101	427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	POU1F1	P28069	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	DCTD	P32321	178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	NPY4R	P50391	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAB5B-209	ENST00000551459	BMX	P51813	675 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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