RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550375.1

BRF1-217, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-217ENST00000550375 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 FAM206AQ9NX38 181 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 H3BSA7 217 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 J3QLW9 94 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 M0R233 179 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 OVOL3O00110 214 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 SULT1C4O75897 302 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 PNPP00491 289 aa14.73□□□□□ -0.05
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BRF1-217ENST00000550375 RAC2P15153 192 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 ZNF19P17023 458 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 DCTDP32321 178 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 PSMB10P40306 273 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 OR12D2P58182 307 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 TIGD6Q17RP2 521 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 LIPNQ5VXI9 398 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 OR2T2Q6IF00 324 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 AHSA2Q719I0 299 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 PGAP1Q75T13 922 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 OR5AS1Q8N127 324 aa14.73□□□□□ -0.05
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BRF1-217ENST00000550375 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 SGK3Q96BR1 496 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 HAVCR1Q96D42 359 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 PERPQ96FX8 193 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 TMEM80Q96HE8 168 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 Q9H521 79 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 INPP5EQ9NRR6 644 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 R4GMQ9 66 aa14.73□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 CSMD2Q7Z408 3487 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 SLC1A7O00341 560 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 XRCC2O43543 280 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 NDUFS7O75251 213 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 DCKP27707 260 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 ETV1P50549 477 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 MVKQ03426 396 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 ST3GAL4Q11206 333 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 GALEQ14376 348 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 CDONQ4KMG0 1287 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 STX19Q8N4C7 294 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 ZNF540Q8NDQ6 660 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 REEP6Q96HR9 211 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.72□□□□□ -0.05
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BRF1-217ENST00000550375 TPK1Q9H3S4 243 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 GPR160Q9UJ42 338 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
BRF1-217ENST00000550375 PTGES3LE9PB15 166 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 TACSTD2P09758 323 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 LIMS3P0CW19 117 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 LIMS4P0CW20 117 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 PIPP12273 146 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 KITLGP21583 273 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 PTH2RP49190 550 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 PPOXP50336 477 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 ACTA2P62736 377 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 ACTG2P63267 376 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 MOGQ16653 247 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 RORBQ92753 470 aa14.71□□□□□ -0.06
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BRF1-217ENST00000550375 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 C4orf36Q96KX1 117 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 ZNF649Q9BS31 505 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 G6PC2Q9NQR9 355 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 SCN3BQ9NY72 215 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.71□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 PLSCR5A0PG75 271 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 GGT3PA6NGU5 568 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 ACOD1A6NK06 481 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 H7C417 338 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 MYL12AP19105 171 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 MMP15P51511 669 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 MMP16P51512 607 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 ATP5J2P56134 94 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 CSNK2BP67870 215 aa14.7□□□□□ -0.06
BRF1-217ENST00000550375 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.7□□□□□ -0.06
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