RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	RELN	P78509	3460 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658		A0A0U1RQV5	110 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GGT3P	A6NGU5	568 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	P2RY10	O00398	339 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CCRL2	O00421	344 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SYT7	O43581	403 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GPRIN2	O60269	458 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ICMT	O60725	284 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	INMT	O95050	263 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CLDN1	O95832	211 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	LALBA	P00709	142 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TTR	P02766	147 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SELE	P16581	610 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CPE	P16870	476 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ACHE	P22303	614 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	NR4A1	P22736	598 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	KIR3DL2	P43630	455 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GPR50	Q13585	617 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TRAM1	Q15629	374 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	XAF1	Q6GPH4	301 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PGAP1	Q75T13	922 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DOK3	Q7L591	496 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	NUP37	Q8NFH4	326 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	THRSP	Q92748	146 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	MUL1	Q969V5	352 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OPALIN	Q96PE5	141 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	HHLA2	Q9UM44	414 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	STARD10	Q9Y365	291 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658		A6NNC1	897 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658		H3BSA7	217 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OGG1	O15527	345 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PLPP2	O43688	288 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SERPINA3	P01011	423 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	NGF	P01138	241 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CD1A	P06126	327 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CD2	P06729	351 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GLRX	P35754	106 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GPR141	Q7Z602	305 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	FTMT	Q8N4E7	242 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GPR148	Q8TDV2	347 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TMED9	Q9BVK6	235 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GPR84	Q9NQS5	396 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DHDH	Q9UQ10	334 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CMAHP	Q9Y471	501 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CAD	P27708	2225 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	SHISA9	B4DS77	424 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658		H3BSH0	61 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	DHRS3	O75911	302 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ZFPL1	O95159	310 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF20	P17024	532 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	CD53	P19397	219 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	GABRA5	P31644	462 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	MAP2K3	P46734	347 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ERVS71-1	P61550	626 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF92	Q03936	586 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TPBG	Q13641	420 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDB1-223	ENST00000543658	PHC2	Q8IXK0	858 aa		10.24	□□□□□ -0.77

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