RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534106.2

CHMP4A-208, Transcript of charged multivesicular body protein 4A, humanhuman

TSL 5

Gene CHMP4A, Length 370 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4A-208ENST00000534106 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 PKHD1P08F94 4074 aa2.4□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.4□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 DNAH2Q9P225 4427 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 A0A1W2PPM1 405 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 PLSCR5A0PG75 271 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC22A23A1A5C7 686 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 A8MVM7 634 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 LRRN3E7EW58 273 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 H3BUX3 64 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 P2RY10O00398 339 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 COPEO14579 308 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 CFLARO15519 480 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 SPRY2O43597 315 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 CHST1O43916 411 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 OR10H3O60404 316 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 PEX11AO75192 247 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 NPIPB7O75200 414 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 STX11O75558 287 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 ATP5HO75947 161 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 VAMP5O95183 116 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 AGR2O95994 175 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 IFI6P09912 130 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 LINC00032P0C843 101 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 DUX4L4P0CJ87 422 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 TAC1P20366 129 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 IMPDH1P20839 514 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 DUSP1P28562 367 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 GRPRP30550 384 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 CDAP32320 146 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 GRK5P34947 590 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 MDH2P40926 338 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 KIR2DS4P43632 304 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 HTR5AP47898 357 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 PITPNBP48739 271 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 RAB13P51153 203 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 PRKAA2P54646 552 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 RPL15P61313 204 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 HBA1P69905 142 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 EPS8Q12929 822 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 PSG7Q13046 419 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 KLRD1Q13241 179 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 PMS2P3Q13401 168 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 SYPL1Q16563 259 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 IMPG1Q17R60 797 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF718Q3SXZ3 478 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 MMEL1Q495T6 779 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 C1orf146Q5VVC0 180 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 LIPMQ5VYY2 423 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 ACSM6Q6P461 480 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 TMEM88Q6PEY1 159 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 C10orf99Q6UWK7 81 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 DCDC5Q6ZRR9 648 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 CYS1Q717R9 158 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 VRK2Q86Y07 508 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 NDUFA11Q86Y39 141 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 SBSPONQ8IVN8 264 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC36Q8IYA8 594 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 CLECL1Q8IZS7 167 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 OR5AS1Q8N127 324 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 CLIP4Q8N3C7 705 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 LRRC18Q8N456 261 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 SLC22A24Q8N4F4 322 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 CCNYL1Q8N7R7 359 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 OR4K5Q8NGD3 323 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 OR52L2PQ8NGH6 319 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 OR6N1Q8NGY5 312 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 GLMPQ8WWB7 406 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 OR5P2Q8WZ92 322 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 ROPN1LQ96C74 230 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 CMBLQ96DG6 245 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 TEX37Q96LM6 180 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 SAMD8Q96LT4 415 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 COG8Q96MW5 612 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 OXGR1Q96P68 337 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 RCHY1Q96PM5 261 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF382Q96SR6 550 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 PAFAH2Q99487 392 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 DDOQ99489 341 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 TXLNGYQ9BZA5 131 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 TRIM15Q9C019 465 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 ZNF350Q9GZX5 532 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 SIRPDQ9H106 197 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 DPAGT1Q9H3H5 408 aa2.39□□□□□ -2.03
CHMP4A-208ENST00000534106 TUBB1Q9H4B7 451 aa2.39□□□□□ -2.03
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