RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529998.5

UBASH3B-205, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 698 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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UBASH3B-205ENST00000529998 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 PGAP1Q75T13 922 aa7.38□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 YIPF5Q969M3 257 aa7.38□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 C18orf12Q96KH6 178 aa7.38□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.38□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.37□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 XRCC2O43543 280 aa7.37□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 OR2T7P0C7T2 308 aa7.37□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 ATP6V1E1P36543 226 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 POU4F2Q12837 409 aa7.37□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.37□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 CYGBQ8WWM9 190 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.37□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 MROQ9BYG7 248 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.37□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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UBASH3B-205ENST00000529998 DECR2Q9NUI1 292 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 TREM2Q9NZC2 230 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 CACNG2Q9Y698 323 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 A0A1B0GWJ7 208 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 GGT3PA6NGU5 568 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 CD300LBA8K4G0 201 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 J3QRE1 110 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 NDUFS8O00217 210 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 PHYHO14832 338 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 MPZL2O60487 215 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF254O75437 659 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 RP2O75695 350 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 PNPP00491 289 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 HLA-DPB1P04440 258 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 CD55P08174 381 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC25A16P16260 332 aa7.36□□□□□ -1.23
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