RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520972.5

ARHGEF10-208, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 10, human

TSL 5

Gene ARHGEF10, Length 2,176 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGEF10-208	ENST00000520972	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972		A0A1W2PPL8	197 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	LNP1	A1A4G5	178 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	OR2M5	A3KFT3	312 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972		I3L521	148 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	IGHG1	P01857	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	HPX	P02790	462 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	ALDOB	P05062	364 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	H2BFM	P0C1H6	154 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	FOLR3	P41439	243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	RAB11B	Q15907	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	BEX1	Q9HBH7	125 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	COPZ2	Q9P299	210 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972		J3KRW8	73 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	ACOT7	O00154	380 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	SULT2B1	O00204	365 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	LDLRAD4	O15165	306 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	SLC31A2	O15432	143 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	SGCE	O43556	437 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	IGHV2-70	P01814	119 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	IFNA4	P05014	189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	PTAFR	P25105	342 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	GSK3A	P49840	483 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	RAG2	P55895	527 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	CLRN1	P58418	232 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	SPOCK1	Q08629	439 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	UCN2	Q96RP3	112 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	SOX7	Q9BT81	388 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	OR51J1	Q9H342	316 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	RAB3D	O95716	219 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	SP9	P0CG40	484 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	BMI1	P35226	326 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	TNK1	Q13470	666 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	CSRP2	Q16527	193 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	LINC00303	Q3SY05	128 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	ELP2	Q6IA86	826 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	OR56B4	Q8NH76	319 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	SPRY4	Q9C004	299 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	NIPAL2	Q9H841	368 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972		A0A087WZY1	265 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972		A0A1B0GTI1	187 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	WIPF3	A6NGB9	483 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972		H7C417	338 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	RER1	O15258	196 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	PMS2P2	O95744	297 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	TGM6	O95932	706 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	CD2	P06729	351 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	FBP1	P09467	338 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	ZNF43	P17038	809 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	VEGFC	P49767	419 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	GNG10	P50151	68 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	CASP6	P55212	293 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	ZP1	P60852	638 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	MAB21L1	Q13394	359 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	RNF144B	Q7Z419	303 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	TMEM156	Q8N614	296 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	LURAP1	Q96LR2	239 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ARHGEF10-208	ENST00000520972	OR2M2	Q96R28	347 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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