RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515690.1

CTBP1-218, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 3

Gene CTBP1, Length 858 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-218	ENST00000515690	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	FUZ	Q9BT04	418 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	SLITRK2	Q9H156	845 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	TMEM100	Q9NV29	134 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690		A0A1B0GWJ7	208 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690		G3V2T6	193 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690		H0YL77	283 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	SOCS2	O14508	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	IMPA2	O14732	288 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	MLNR	O43193	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	KCNAB3	O43448	404 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	CCNB2	O95067	398 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	PLAT	P00750	562 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	SELE	P16581	610 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	ZNF404	Q494X3	552 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	FGD3	Q5JSP0	725 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	LINC00471	Q8N535	108 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	GIPC3	Q8TF64	312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	ERGIC1	Q969X5	290 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	EME1	Q96AY2	570 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	OR8B2	Q96RD0	313 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	CIB1	Q99828	191 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690		F5H5P2	479 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	ZNF205	O95201	554 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	PEX2	P28328	305 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	GATA4	P43694	442 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	CENPA	P49450	140 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	FXYD6P3	P58550	94 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	BPIFB3	P59826	476 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	COX10	Q12887	443 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	MICA	Q29983	383 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	C16orf87	Q6PH81	154 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	C8orf4	Q9NR00	106 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	B9D1	Q9UPM9	204 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	UNC119B	A6NIH7	251 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	GPANK1	O95872	356 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	IRF2	P14316	349 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	PRKACG	P22612	351 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	FPR3	P25089	353 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	PMEL	P40967	661 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	PITPNB	P48739	271 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	ECH1	Q13011	328 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	SEC23B	Q15437	767 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	TREML4	Q6UXN2	200 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690		Q8TCH9	128 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	TSSK2	Q96PF2	358 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	CLN8	Q9UBY8	286 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		11.1	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690		A0A1B0GUS0	222 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	DCTN6	O00399	190 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	PHYH	O14832	338 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	ARPC3	O15145	178 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	OR10H3	O60404	316 aa		11.09	□□□□□ -0.63
CTBP1-218	ENST00000515690	PPP1R3D	O95685	299 aa		11.09	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms