RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 CLN8Q9UBY8 286 aa20.61■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa20.61■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 TRAV40A0A0B4J280 105 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 FAM20BO75063 409 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 CCNB2O95067 398 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 HKR1P10072 659 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 ATP6V1B2P21281 511 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 FOXL1Q12952 345 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 SNAI3Q3KNW1 292 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 LYPD4Q6UWN0 246 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 SLC37A3Q8NCC5 494 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 OR8D4Q8NGM9 314 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 UPRTQ96BW1 309 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 DDOQ99489 341 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 COPS4Q9BT78 406 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 UFSP2Q9NUQ7 469 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.6■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 CD300LBA8K4G0 201 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 PHYHO14832 338 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 CA6P23280 308 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 MAGEA2P43356 314 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF92Q03936 586 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 DRAM2Q6UX65 266 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 DCXRQ7Z4W1 244 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 OR51L1Q8NGJ5 315 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 OR2AE1Q8NHA4 323 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 ZNRF4Q8WWF5 429 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 FN3KRPQ9HA64 309 aa20.59■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 GGT3PA6NGU5 568 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 GASTP01350 101 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 SPARCP09486 303 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 PSKH1P11801 424 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 MTNR1AP48039 350 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 MPPED2Q15777 294 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 GLYATL3Q5SZD4 288 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 LYPD2Q6UXB3 125 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 C9orf139Q6ZV77 190 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 PIGWQ7Z7B1 504 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 C19orf18Q8NEA5 215 aa20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ALYREF-203ENST00000511412 DOCK11Q5JSL3 2073 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 GMDSO60547 372 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 PLATP00750 562 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 EGR1P18146 543 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 ENTPD1P49961 510 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 MNAT1P51948 309 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 GYS2P54840 703 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 CRMP1Q14194 572 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 LNX2Q8N448 690 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 SLC25A28Q96A46 364 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 MAGIXQ9H6Y5 334 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 BAIAP2Q9UQB8 552 aa20.57■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 ANOS1P23352 680 aa20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 FMO3P31513 532 aa20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 TAF13Q15543 124 aa20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 KCNJ8Q15842 424 aa20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 FITM2Q8N6M3 262 aa20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 OR2T33Q8NG76 320 aa20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 SLAMF6Q96DU3 332 aa20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 OPA3Q9H6K4 179 aa20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 RNF7Q9UBF6 113 aa20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa20.56■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 TCRBV5S2A0A599 114 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF878C9JN71 531 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 CLDN34H7C241 214 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 SOX14O95416 240 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 GYPBP06028 91 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 PSMB10P40306 273 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 NPY4RP50391 375 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 PRKXP51817 358 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 PCK2Q16822 640 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF841Q6ZN19 808 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 PLPP7Q8NBV4 271 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 OR4Q3Q8NH05 313 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 TECTBQ96PL2 329 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 KCNJ15Q99712 375 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF747Q9BV97 191 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 MUC13Q9H3R2 512 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 CENPMQ9NSP4 180 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.55■□□□□ 0.88
ALYREF-203ENST00000511412 C5orf63A6NC05 138 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms