RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNASE1L1P49184 302 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RIDAP52758 137 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CAPZA1P52907 286 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TAS2R19P59542 299 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GMFBP60983 142 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CXADRP78310 365 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DEFA5Q01523 94 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BAMBIQ13145 260 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP1R1AQ13522 171 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TDGQ13569 410 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DEFB133Q30KQ1 61 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CDNFQ49AH0 187 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC157Q569K6 752 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIAA0895LQ68EN5 471 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LANCL3Q6ZV70 420 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DCXRQ7Z4W1 244 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NAXDQ8IW45 347 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHST4Q8NCG5 386 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PXT1Q8NFP0 134 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LMX1AQ8TE12 382 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CASTOR1Q8WTX7 329 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FGGYQ96C11 551 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SOX7Q9BT81 388 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EMC6Q9BV81 110 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CST11Q9H112 138 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CNTD2Q9H8S5 307 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MED9Q9NWA0 146 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MED29Q9NX70 200 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLCL2Q9UPR0 1127 aa5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MED12Q93074 2177 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RTTNQ86VV8 2226 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR14I1A6ND48 311 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FRG2CA6NGY1 282 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LDLRAD4O15165 306 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSPAN2O60636 221 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM127O75204 238 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSPAN9O75954 239 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PMS2P2O95744 297 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYB5AP00167 134 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GNB3P16520 340 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DRD1P21728 446 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABCD3P28288 659 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CD34P28906 385 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CAPZBP47756 277 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SKP1P63208 163 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLCXD2Q0VAA5 305 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SERTAD2Q14140 314 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EBPQ15125 230 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NSDHLQ15738 373 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SGCBQ16585 318 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GLT8D1Q68CQ7 371 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMPPEQ6ZT21 453 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KCTD9Q7L273 389 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FJX1Q86VR8 437 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TXNIPQ9H3M7 391 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FN3KRPQ9HA64 309 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CUTCQ9NTM9 273 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR52A1Q9UKL2 312 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RNF222A6NCQ9 220 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MS4A18H0YCH9 400 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BET1O15155 118 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF217O75362 1048 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AQP8O94778 261 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL18BPO95998 194 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UNC119Q13432 240 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR7A5Q15622 319 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MPPED2Q15777 294 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MS4A18Q3C1V0 323 aa5.83□□□□□ -1.48
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms