RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 ASAH2BP0C7U1 165 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 NKAIN3Q8N8D7 197 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 OR4D6Q8NGJ1 314 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 RADILQ96JH8 1075 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 EMC3Q9P0I2 261 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 NXPH3O95157 252 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CD79AP11912 226 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 TPT1P13693 172 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CXCL2P19875 107 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP1B3P54709 279 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CCL7P80098 99 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CLLU1Q5K131 121 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 MISPQ8IVT2 679 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 OR56B1Q8NGI3 324 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 MPC2O95563 127 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 MOGAT2Q3SYC2 334 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 TRILQ7L0X0 811 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 C20orf196Q8IYI0 205 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CACNA1HO95180 2353 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNHIT1O43257 154 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 GDF1P27539 372 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SUMF1Q8NBK3 374 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF721Q8TF20 911 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00052Q96N35 136 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 GDF15Q99988 308 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF649Q9BS31 505 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 LDAHQ9H6V9 325 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 OPN4Q9UHM6 478 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 BET1O15155 118 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 RAB6AP20340 208 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 RAG2P55895 527 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXK1P85037 733 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 OPN5Q6U736 354 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 MOB3CQ70IA8 216 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ST8SIA2Q92186 375 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ARL11Q969Q4 196 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC46Q96FV0 321 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PISDQ9UG56 409 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PP11 408 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 DDAH2O95865 285 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PET100P0DJ07 73 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 BTCP35070 178 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 UBA52P62987 128 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SEH1LQ96EE3 360 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ESPL1Q14674 2120 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 H3BMH7 237 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 MASP2O00187 686 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 MED6O75586 246 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 LYPD3O95274 346 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 BGLAPP02818 100 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ADH6P28332 368 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 RHBDD1Q8TEB9 315 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ST8SIA1Q92185 356 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 DHRS9Q9BPW9 319 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAP1O75689 374 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 IL5P05113 134 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 C5orf46Q6UWT4 87 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 AAED1Q7RTV5 226 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 OR2AE1Q8NHA4 323 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SOSTQ9BQB4 213 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 DENND4CQ5VZ89 1909 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 D6RAR5 112 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 EPHA1P21709 976 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 S100GP29377 79 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 FOLR3P41439 243 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 OR3A4PP47883 348 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 PCK2Q16822 640 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.41□□□□□ -0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms