RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 RDH12Q96NR8 316 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 OR8B4Q96RC9 309 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 TBX5Q99593 518 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 PLCE1Q9P212 2302 aa7.36□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 RTTNQ86VV8 2226 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 PLSCR5A0PG75 271 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 VWC2LB2RUY7 222 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 H0YL77 283 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 MT-ND5P03915 603 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ADH4P08319 380 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 CSF3P09919 207 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 LIPAP38571 399 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 DSCR9P59020 149 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ROM1Q03395 351 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 SLC34A1Q06495 639 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 POU4F2Q12837 409 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 CDK5R2Q13319 367 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 TMED1Q13445 227 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ZNF691Q5VV52 312 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 MEDAGQ5VYS4 303 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 PGAP1Q75T13 922 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ZNF786Q8N393 782 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 OR8G5Q8NG78 346 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 OR10H4Q8NGA5 316 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 RHOXF1Q8NHV9 184 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 NRG4Q8WWG1 115 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 CYGBQ8WWM9 190 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 RFKQ969G6 155 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 SPSB4Q96A44 273 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 SGK3Q96BR1 496 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 RNFT2Q96EX2 444 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 PGAM5Q96HS1 289 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 C18orf12Q96KH6 178 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 MNTQ99583 582 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 SMR3AQ99954 134 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 APOL4Q9BPW4 351 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 SOX7Q9BT81 388 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 REG4Q9BYZ8 158 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 C8orf4Q9NR00 106 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 CLN6Q9NWW5 311 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 CACNG2Q9Y698 323 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.35□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 CD300LBA8K4G0 201 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 H0YHG0 523 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 J3QRE1 110 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 PHYHO14832 338 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 MLNRO43193 412 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 XRCC2O43543 280 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 MPZL2O60487 215 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 CDC14BO60729 498 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 RP2O75695 350 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 PNPP00491 289 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 APOC1P02654 83 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 HLA-DPB1P04440 258 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 CD55P08174 381 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 INHBBP09529 407 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 OR2T7P0C7T2 308 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 SELEP16581 610 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ATP6V1E1P36543 226 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 MTNR1AP48039 350 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 FAM3AP98173 230 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 IL5RAQ01344 420 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ZNF85Q03923 595 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 ZNF91Q05481 1191 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 RIN1Q13671 783 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 TIGD6Q17RP2 521 aa7.34□□□□□ -1.23
PKP4-216ENST00000495123 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms