RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OPN4Q9UHM6 478 aa6.96□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 POMPQ9Y244 141 aa6.96□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 CD300LBA8K4G0 201 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 A8MXK9 166 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF878C9JN71 531 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 GNGT2O14610 69 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 E2F6O75461 281 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 FOXH1O75593 365 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 VENTXO95231 258 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 FSHBP01225 129 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 EPHA1P21709 976 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PRKACGP22612 351 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 CA6P23280 308 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 POU1F1P28069 291 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 RAD23AP54725 363 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 CBX1P83916 185 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 GINS1Q14691 196 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TEX30Q5JUR7 227 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 DRAM2Q6UX65 266 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OTULINQ96BN8 352 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 INTS14Q96SY0 518 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OCEL1Q9H607 264 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 MMP26Q9NRE1 261 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 CENPMQ9NSP4 180 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM100Q9NV29 134 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 METRNQ9UJH8 293 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.95□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 J3QLI3 93 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 SELENOFO60613 162 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 FAM20BO75063 409 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 GLCEO94923 617 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OSMP13725 252 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 GATA3P23771 443 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 GSTT1P30711 240 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 CD200P41217 278 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 GATA4P43694 442 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 CX3CR1P49238 355 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TAF13Q15543 124 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OR8G1Q15617 311 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 MPPED2Q15777 294 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 KLBQ86Z14 1044 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TIGD4Q8IY51 512 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 Q8TCH9 128 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 KCNJ15Q99712 375 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC6A7Q99884 636 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ABHD6Q9BV23 337 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 MARCH7Q9H992 704 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 NTN4Q9HB63 628 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TMEM165Q9HC07 324 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.94□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.93□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.93□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.93□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 GGT3PA6NGU5 568 aa6.93□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PPIAL4DF5H284 164 aa6.93□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 IFNL4K9M1U5 179 aa6.93□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TBX1O43435 398 aa6.93□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TIPRLO75663 272 aa6.93□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 WNT2P09544 360 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms