RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 M1APQ8TC57 530 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PHYHIPQ92561 330 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MYOTQ9UBF9 498 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LRP12Q9Y561 859 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KRT33AO76009 404 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PTH2RP49190 550 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
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HERC4-211ENST00000492996 CAMK2DQ13557 499 aa6.23□□□□□ -1.41
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HERC4-211ENST00000492996 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 STK35Q8TDR2 534 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MR1Q95460 341 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 AUP1Q9Y679 476 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PRSS47A8MTI9 375 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SSNA1O43805 119 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 LMX1BO60663 402 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TNFSF15O95150 251 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KLK2P20151 261 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 P2RY4P51582 365 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HSF1Q00613 529 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 C4orf17Q53FE4 359 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HGDQ93099 445 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CXorf58Q96LI9 332 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RBP7Q96R05 134 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR5B2Q96R09 309 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR51J1Q9H342 316 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 KLHL9Q9P2J3 617 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NDRG3Q9UGV2 375 aa6.22□□□□□ -1.41
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HERC4-211ENST00000492996 HPXP02790 462 aa6.22□□□□□ -1.41
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HERC4-211ENST00000492996 ITGA5P08648 1049 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ANXA3P12429 323 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CRABP1P29762 137 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 VEGFCP49767 419 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CCR9P51686 369 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R20P59543 309 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 BTG1P62324 171 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 GUCA2AQ02747 115 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 SPOCK1Q08629 439 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MYBPHQ13203 477 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR10K2Q6IF99 312 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NUBPLQ8TB37 319 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RNF128Q8TEB7 428 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ST8SIA1Q92185 356 aa6.22□□□□□ -1.41
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HERC4-211ENST00000492996 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 CHST11Q9NPF2 352 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 DHDHQ9UQ10 334 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 TRAV18A0A075B6X5 111 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 PHYHO14832 338 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 RAMP1O60894 148 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 STOMP27105 288 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 COTL1Q14019 142 aa6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
HERC4-211ENST00000492996 MAJINQ3KP22 176 aa6.21□□□□□ -1.41
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